Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G267700.1
Synonym Sb02g030170
Functional annotation bZIP family transcription factor, putative, expressed
UniProt C5X612
Pfam PF00170
Panther DB PTHR13690 PTHR13690:SF83
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006355; regulation of transcription, DNA-templated GO:0003700DNA-binding transcription factor activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G38900 : Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g43090.1 : bZIP family transcription factor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a014370 , Zm00025a047692
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G267700


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.004G171600 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G267700 Sobic002G267700 Sobic005G033600 Sobic005G033600 Sobic002G267700--Sobic005G033600 Sobic006G070830 Sobic006G070830 Sobic002G267700--Sobic006G070830 Sobic008G031400 Sobic008G031400 Sobic002G267700--Sobic008G031400 Sobic006G031000 Sobic006G031000 Sobic002G267700--Sobic006G031000 Sobic005G174500 Sobic005G174500 Sobic002G267700--Sobic005G174500 Sobic002G089500 Sobic002G089500 Sobic002G267700--Sobic002G089500 Sobic005G032500 Sobic005G032500 Sobic002G267700--Sobic005G032500 Sobic003G091500 Sobic003G091500 Sobic002G267700--Sobic003G091500 Sobic006G117300 Sobic006G117300 Sobic002G267700--Sobic006G117300 Sobic005G174200 Sobic005G174200 Sobic005G033600--Sobic005G174200 Sobic005G033600--Sobic002G267700 Sobic007G032500 Sobic007G032500 Sobic005G033600--Sobic007G032500 Sobic009G139500 Sobic009G139500 Sobic005G033600--Sobic009G139500 Sobic003G211600 Sobic003G211600 Sobic005G033600--Sobic003G211600 Sobic005G033600--Sobic006G070830 Sobic001G374600 Sobic001G374600 Sobic005G033600--Sobic001G374600 Sobic002G015400 Sobic002G015400 Sobic005G033600--Sobic002G015400 Sobic005G033600--Sobic003G091500 Sobic006G070830--Sobic005G174200 Sobic006G070830--Sobic002G267700 Sobic005G173900 Sobic005G173900 Sobic006G070830--Sobic005G173900 Sobic006G070830--Sobic005G174500 Sobic006G070830--Sobic005G033600 Sobic008G184100 Sobic008G184100 Sobic006G070830--Sobic008G184100 Sobic006G070830--Sobic003G091500 Sobic006G070830--Sobic001G374600 Sobic007G040000 Sobic007G040000 Sobic006G070830--Sobic007G040000 Sobic008G031400--Sobic008G184100 Sobic008G031400--Sobic003G091500 Sobic008G031400--Sobic005G032500 Sobic008G088900 Sobic008G088900 Sobic008G031400--Sobic008G088900 Sobic007G037200 Sobic007G037200 Sobic008G031400--Sobic007G037200 Sobic001G489075 Sobic001G489075 Sobic008G031400--Sobic001G489075 Sobic004G171600 Sobic004G171600 Sobic008G031400--Sobic004G171600 Sobic002G108300 Sobic002G108300 Sobic008G031400--Sobic002G108300 Sobic002G293100 Sobic002G293100 Sobic008G031400--Sobic002G293100 Sobic002G166800 Sobic002G166800 Sobic006G031000--Sobic002G166800 Sobic010G010300 Sobic010G010300 Sobic006G031000--Sobic010G010300 Sobic006G031000--Sobic006G117300 Sobic002G101200 Sobic002G101200 Sobic006G031000--Sobic002G101200 Sobic006G031000--Sobic002G267700 Sobic006G031000--Sobic009G139500 Sobic006G031000--Sobic005G032500 Sobic001G392900 Sobic001G392900 Sobic006G031000--Sobic001G392900 Sobic002G053100 Sobic002G053100 Sobic006G031000--Sobic002G053100 Sobic009G090250 Sobic009G090250 Sobic005G174500--Sobic009G090250 Sobic001G246400 Sobic001G246400 Sobic005G174500--Sobic001G246400 Sobic005G174500--Sobic007G040000 Sobic005G174500--Sobic005G173900 Sobic002G007700 Sobic002G007700 Sobic005G174500--Sobic002G007700 Sobic005G174500--Sobic006G117300 Sobic005G174500--Sobic003G091500 Sobic005G174500--Sobic002G089500 Sobic003G207100 Sobic003G207100 Sobic005G174500--Sobic003G207100 Sobic005G021100 Sobic005G021100 Sobic002G089500--Sobic005G021100 Sobic002G089500--Sobic001G392900 Sobic002G089500--Sobic002G007700 Sobic002G089500--Sobic004G171600 Sobic001G233600 Sobic001G233600 Sobic002G089500--Sobic001G233600 Sobic002G089500--Sobic002G293100 Sobic005G077900 Sobic005G077900 Sobic002G089500--Sobic005G077900 Sobic001G200900 Sobic001G200900 Sobic002G089500--Sobic001G200900 Sobic005G174000 Sobic005G174000 Sobic002G089500--Sobic005G174000 Sobic005G032500--Sobic007G037200 Sobic002G100000 Sobic002G100000 Sobic005G032500--Sobic002G100000 Sobic005G032500--Sobic008G031400 Sobic002G058900 Sobic002G058900 Sobic005G032500--Sobic002G058900 Sobic008G159300 Sobic008G159300 Sobic005G032500--Sobic008G159300 Sobic002G217000 Sobic002G217000 Sobic005G032500--Sobic002G217000 Sobic004G220900 Sobic004G220900 Sobic005G032500--Sobic004G220900 Sobic005G032500--Sobic002G101200 Sobic004G212350 Sobic004G212350 Sobic005G032500--Sobic004G212350 Sobic003G091500--Sobic008G184100 Sobic003G091500--Sobic008G088900 Sobic003G091500--Sobic002G108300 Sobic003G091500--Sobic002G007700 Sobic003G091500--Sobic004G171600 Sobic003G091500--Sobic003G207100 Sobic003G091500--Sobic001G233600 Sobic003G091500--Sobic008G031400 Sobic003G091500--Sobic005G077900 Sobic006G117300--Sobic007G040000 Sobic003G321500 Sobic003G321500 Sobic006G117300--Sobic003G321500 Sobic006G117300--Sobic009G090250 Sobic006G117300--Sobic005G174500 Sobic006G117300--Sobic001G246400 Sobic006G117300--Sobic006G031000 Sobic001G270600 Sobic001G270600 Sobic006G117300--Sobic001G270600 Sobic006G117300--Sobic002G267700 Sobic006G117300--Sobic002G089500
Octagon: transcription factors


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