Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G207100.3,Sobic.003G207100.4
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1W0VYB2
Pfam -
Panther DB PTHR33157 PTHR33157:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g41770.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G007700 nodulin family protein, putative, expressed -
2 Sobic.003G091500 expressed protein -
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8 Sobic.005G174500 - -
9 Sobic.008G088900 hypothetical protein -
10 Sobic.005G021100 - -
11 Sobic.005G174000 - -
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14 Sobic.001G392900 - -
15 Sobic.008G031400 OsSub63 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
16 Sobic.002G108300 expressed protein -
17 Sobic.005G173800 DEFL12 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
18 Sobic.009G040000 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
19 Sobic.003G207600 OsFBD5 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
20 Sobic.001G489075 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G207100 Sobic003G207100 Sobic002G007700 Sobic002G007700 Sobic003G207100--Sobic002G007700 Sobic003G091500 Sobic003G091500 Sobic003G207100--Sobic003G091500 Sobic008G184100 Sobic008G184100 Sobic003G207100--Sobic008G184100 Sobic002G089500 Sobic002G089500 Sobic003G207100--Sobic002G089500 Sobic001G233600 Sobic001G233600 Sobic003G207100--Sobic001G233600 Sobic004G171600 Sobic004G171600 Sobic003G207100--Sobic004G171600 Sobic005G077900 Sobic005G077900 Sobic003G207100--Sobic005G077900 Sobic005G174500 Sobic005G174500 Sobic003G207100--Sobic005G174500 Sobic008G088900 Sobic008G088900 Sobic003G207100--Sobic008G088900 Sobic002G007700--Sobic001G233600 Sobic002G007700--Sobic004G171600 Sobic002G007700--Sobic002G089500 Sobic002G007700--Sobic005G077900 Sobic005G174000 Sobic005G174000 Sobic002G007700--Sobic005G174000 Sobic002G007700--Sobic003G091500 Sobic002G007700--Sobic008G184100 Sobic005G021100 Sobic005G021100 Sobic002G007700--Sobic005G021100 Sobic002G007700--Sobic008G088900 Sobic003G091500--Sobic008G184100 Sobic003G091500--Sobic008G088900 Sobic002G108300 Sobic002G108300 Sobic003G091500--Sobic002G108300 Sobic003G091500--Sobic002G007700 Sobic003G091500--Sobic004G171600 Sobic003G091500--Sobic003G207100 Sobic003G091500--Sobic001G233600 Sobic008G031400 Sobic008G031400 Sobic003G091500--Sobic008G031400 Sobic003G091500--Sobic005G077900 Sobic008G184100--Sobic003G091500 Sobic008G184100--Sobic008G088900 Sobic008G184100--Sobic002G108300 Sobic008G184100--Sobic002G007700 Sobic008G184100--Sobic004G171600 Sobic008G184100--Sobic008G031400 Sobic008G184100--Sobic001G233600 Sobic008G184100--Sobic003G207100 Sobic008G184100--Sobic005G174000 Sobic002G089500--Sobic005G021100 Sobic001G392900 Sobic001G392900 Sobic002G089500--Sobic001G392900 Sobic002G089500--Sobic002G007700 Sobic002G089500--Sobic004G171600 Sobic002G089500--Sobic001G233600 Sobic002G293100 Sobic002G293100 Sobic002G089500--Sobic002G293100 Sobic002G089500--Sobic005G077900 Sobic001G200900 Sobic001G200900 Sobic002G089500--Sobic001G200900 Sobic002G089500--Sobic005G174000 Sobic001G233600--Sobic002G007700 Sobic001G233600--Sobic004G171600 Sobic001G233600--Sobic005G077900 Sobic001G233600--Sobic005G174000 Sobic001G233600--Sobic001G200900 Sobic001G233600--Sobic002G089500 Sobic001G233600--Sobic005G021100 Sobic001G233600--Sobic008G088900 Sobic001G233600--Sobic002G293100 Sobic004G171600--Sobic005G077900 Sobic004G171600--Sobic005G174000 Sobic004G171600--Sobic001G200900 Sobic004G171600--Sobic002G293100 Sobic004G171600--Sobic002G007700 Sobic004G171600--Sobic001G233600 Sobic004G171600--Sobic005G021100 Sobic004G171600--Sobic008G088900 Sobic004G171600--Sobic002G089500 Sobic005G077900--Sobic004G171600 Sobic005G077900--Sobic005G174000 Sobic005G077900--Sobic001G200900 Sobic005G077900--Sobic002G293100 Sobic005G077900--Sobic001G233600 Sobic005G077900--Sobic002G007700 Sobic005G077900--Sobic005G021100 Sobic001G489075 Sobic001G489075 Sobic005G077900--Sobic001G489075 Sobic005G077900--Sobic008G088900 Sobic009G090250 Sobic009G090250 Sobic005G174500--Sobic009G090250 Sobic001G246400 Sobic001G246400 Sobic005G174500--Sobic001G246400 Sobic007G040000 Sobic007G040000 Sobic005G174500--Sobic007G040000 Sobic005G173900 Sobic005G173900 Sobic005G174500--Sobic005G173900 Sobic005G174500--Sobic002G007700 Sobic006G117300 Sobic006G117300 Sobic005G174500--Sobic006G117300 Sobic005G174500--Sobic003G091500 Sobic005G174500--Sobic002G089500 Sobic005G174500--Sobic003G207100 Sobic008G088900--Sobic002G108300 Sobic008G088900--Sobic003G091500 Sobic008G088900--Sobic008G184100 Sobic008G088900--Sobic004G171600 Sobic008G088900--Sobic001G489075 Sobic008G088900--Sobic005G174000 Sobic008G088900--Sobic005G077900 Sobic008G088900--Sobic002G007700 Sobic005G146966 Sobic005G146966 Sobic008G088900--Sobic005G146966
Octagon: transcription factors


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