Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G082100.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6P7D5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G027700 xylosyltransferase, putative, expressed -
2 Sobic.005G083160 - -
3 Sobic.010G107300 - -
4 Sobic.009G218100 transcription initiation factor IIB, putative, expressed K03124: TFIIB, GTF2B, SUA7, transcription initiation factor TFIIB
5 Sobic.005G226150 - -
6 Sobic.003G342000 bet v I allergen family protein, putative, expressed K14496: abscisic acid receptor PYR/PYL family
7 Sobic.001G233900 expressed protein -
8 Sobic.008G088881 - -
9 Sobic.010G078200 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
10 Sobic.008G037000 Ser/Thr protein phosphatase family protein, putative, expressed -
11 Sobic.010G022600 encodes granule-bound ADP-glucose-gluosyl transferase(PubMedID : 20585750)@-(PubMedID : 9866201)@starch synthase, putative, expressed K13679: granule-bound starch synthase
12 Sobic.002G016250 - -
13 Sobic.001G277800 transferase family protein, putative, expressed -
14 Sobic.002G360900 GASR9 - Gibberellin-regulated GASA/GAST/Snakin family protein precursor, expressed -
15 Sobic.008G064250 - -
16 Sobic.003G323000 - -
17 Sobic.010G031600 early nodulin 93 ENOD93 protein, putative, expressed -
18 Sobic.001G421200 protein phosphatase 2C, putative, expressed -
19 Sobic.005G165632 - -
20 Sobic.005G085700 heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase, putative, expressed K10532: heparan-alpha-glucosaminide N-acetyltransferase


Gene co-expression network
sample Sobic009G082100 Sobic009G082100 Sobic003G027700 Sobic003G027700 Sobic009G082100--Sobic003G027700 Sobic005G083160 Sobic005G083160 Sobic009G082100--Sobic005G083160 Sobic010G107300 Sobic010G107300 Sobic009G082100--Sobic010G107300 Sobic009G218100 Sobic009G218100 Sobic009G082100--Sobic009G218100 Sobic005G226150 Sobic005G226150 Sobic009G082100--Sobic005G226150 Sobic003G342000 Sobic003G342000 Sobic009G082100--Sobic003G342000 Sobic001G233900 Sobic001G233900 Sobic009G082100--Sobic001G233900 Sobic008G088881 Sobic008G088881 Sobic009G082100--Sobic008G088881 Sobic010G078200 Sobic010G078200 Sobic009G082100--Sobic010G078200 Sobic002G381750 Sobic002G381750 Sobic003G027700--Sobic002G381750 Sobic003G027700--Sobic003G342000 Sobic003G027700--Sobic009G082100 Sobic002G016250 Sobic002G016250 Sobic003G027700--Sobic002G016250 Sobic005G165632 Sobic005G165632 Sobic003G027700--Sobic005G165632 Sobic008G064250 Sobic008G064250 Sobic003G027700--Sobic008G064250 Sobic003G027700--Sobic009G218100 Sobic003G027700--Sobic005G083160 Sobic003G389400 Sobic003G389400 Sobic003G027700--Sobic003G389400 Sobic005G083160--Sobic010G107300 Sobic005G083160--Sobic005G226150 Sobic010G022600 Sobic010G022600 Sobic005G083160--Sobic010G022600 Sobic005G083160--Sobic008G088881 Sobic005G083160--Sobic009G218100 Sobic002G360900 Sobic002G360900 Sobic005G083160--Sobic002G360900 Sobic005G083160--Sobic001G233900 Sobic003G101200 Sobic003G101200 Sobic005G083160--Sobic003G101200 Sobic003G323000 Sobic003G323000 Sobic005G083160--Sobic003G323000 Sobic010G107300--Sobic005G083160 Sobic010G107300--Sobic005G226150 Sobic010G107300--Sobic010G022600 Sobic010G107300--Sobic008G088881 Sobic010G107300--Sobic002G360900 Sobic010G107300--Sobic001G233900 Sobic003G247700 Sobic003G247700 Sobic010G107300--Sobic003G247700 Sobic010G107300--Sobic003G323000 Sobic007G070700 Sobic007G070700 Sobic010G107300--Sobic007G070700 Sobic009G218100--Sobic005G083160 Sobic009G218100--Sobic008G064250 Sobic009G218100--Sobic005G165632 Sobic009G218100--Sobic002G016250 Sobic009G218100--Sobic010G107300 Sobic009G218100--Sobic003G342000 Sobic009G218100--Sobic003G101200 Sobic008G113350 Sobic008G113350 Sobic009G218100--Sobic008G113350 Sobic009G218100--Sobic002G360900 Sobic005G226150--Sobic003G247700 Sobic005G226150--Sobic007G070700 Sobic009G245750 Sobic009G245750 Sobic005G226150--Sobic009G245750 Sobic001G253501 Sobic001G253501 Sobic005G226150--Sobic001G253501 Sobic008G103066 Sobic008G103066 Sobic005G226150--Sobic008G103066 Sobic005G226150--Sobic008G088881 Sobic009G001600 Sobic009G001600 Sobic005G226150--Sobic009G001600 Sobic005G174900 Sobic005G174900 Sobic005G226150--Sobic005G174900 Sobic007G025300 Sobic007G025300 Sobic005G226150--Sobic007G025300 Sobic003G342000--Sobic002G016250 Sobic003G342000--Sobic003G389400 Sobic009G231500 Sobic009G231500 Sobic003G342000--Sobic009G231500 Sobic003G342000--Sobic008G064250 Sobic002G274900 Sobic002G274900 Sobic003G342000--Sobic002G274900 Sobic001G203100 Sobic001G203100 Sobic003G342000--Sobic001G203100 Sobic007G036600 Sobic007G036600 Sobic003G342000--Sobic007G036600 Sobic003G226000 Sobic003G226000 Sobic003G342000--Sobic003G226000 Sobic006G154300 Sobic006G154300 Sobic003G342000--Sobic006G154300 Sobic001G233900--Sobic008G088881 Sobic001G233900--Sobic005G226150 Sobic005G225000 Sobic005G225000 Sobic001G233900--Sobic005G225000 Sobic005G199101 Sobic005G199101 Sobic001G233900--Sobic005G199101 Sobic010G153800 Sobic010G153800 Sobic001G233900--Sobic010G153800 Sobic002G091800 Sobic002G091800 Sobic001G233900--Sobic002G091800 Sobic001G233900--Sobic010G107300 Sobic002G344900 Sobic002G344900 Sobic001G233900--Sobic002G344900 Sobic010G148600 Sobic010G148600 Sobic001G233900--Sobic010G148600 Sobic008G088881--Sobic005G226150 Sobic009G007500 Sobic009G007500 Sobic008G088881--Sobic009G007500 Sobic006G062700 Sobic006G062700 Sobic008G088881--Sobic006G062700 Sobic008G088450 Sobic008G088450 Sobic008G088881--Sobic008G088450 Sobic001G112250 Sobic001G112250 Sobic008G088881--Sobic001G112250 Sobic008G088881--Sobic008G103066 Sobic008G088881--Sobic007G070700 Sobic008G088881--Sobic005G174900 Sobic001G249233 Sobic001G249233 Sobic008G088881--Sobic001G249233 Sobic010G078200--Sobic007G070700 Sobic007G083300 Sobic007G083300 Sobic010G078200--Sobic007G083300 Sobic007G049400 Sobic007G049400 Sobic010G078200--Sobic007G049400 Sobic001G277800 Sobic001G277800 Sobic010G078200--Sobic001G277800 Sobic005G140400 Sobic005G140400 Sobic010G078200--Sobic005G140400 Sobic010G078200--Sobic003G247700 Sobic002G077500 Sobic002G077500 Sobic010G078200--Sobic002G077500 Sobic010G078200--Sobic001G253501 Sobic010G078200--Sobic009G245750
Octagon: transcription factors


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