Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G013100.2,Sobic.008G013100.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PAP7
Pfam -
Panther DB PTHR34567
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G03990 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g58700.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G105600 no apical meristem protein, putative, expressed -
2 Sobic.006G059900 "ZmIPT2(Ortholog in maize:Weng et al., 2013)"(PubMedID : 31659896)@IPP transferase, putative, expressed K10760: adenylate dimethylallyltransferase (cytokinin synthase)
3 Sobic.009G022700 - -
4 Sobic.001G326000 expressed protein -
5 Sobic.003G438700 AWPM-19-like membrane family protein, putative, expressed -
6 Sobic.009G186400 SSA1 - 2S albumin seed storage family protein precursor, expressed -
7 Sobic.003G323000 - -
8 Sobic.004G313800 - -
9 Sobic.005G187100 - -
10 Sobic.005G223200 - -
11 Sobic.002G077500 LTPL169 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
12 Sobic.003G350900 homeobox domain containing protein, expressed -
13 Sobic.007G156300 similar to Abscisic acid 8'-hydroxylase 2(PubMedID : 29862293)@cytochrome P450, putative, expressed -
14 Sobic.006G154300 Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@Up-reguralion under combine stress of drought and heat(PubMedID : 24916767)@KUN1 - Kunitz-type trypsin inhibitor precursor, expressed -
15 Sobic.001G259300 tran- scriptional repressor JASMONATE ZIM-DOMAIN(PubMedID : 25711704)@zinc-finger protein, putative, expressed -
16 Sobic.004G254400 tentative name(PubMedID : 31536532)@histone-like transcription factor and archaeal histone, putative, expressed -
17 Sobic.010G136300 osMFT1 MFT-Like1 homologous to Mother of FT and TFL1 gene@ contains Pfam profile PF01161: Phosphatidylethanolamine-binding protein, expressed -
18 Sobic.009G010150 - -
19 Sobic.010G031600 early nodulin 93 ENOD93 protein, putative, expressed -
20 Sobic.002G344900 MBTB21 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein


Gene co-expression network
sample Sobic008G013100 Sobic008G013100 Sobic003G105600 Sobic003G105600 Sobic008G013100--Sobic003G105600 Sobic006G059900 Sobic006G059900 Sobic008G013100--Sobic006G059900 Sobic009G022700 Sobic009G022700 Sobic008G013100--Sobic009G022700 Sobic001G326000 Sobic001G326000 Sobic008G013100--Sobic001G326000 Sobic003G438700 Sobic003G438700 Sobic008G013100--Sobic003G438700 Sobic009G186400 Sobic009G186400 Sobic008G013100--Sobic009G186400 Sobic003G323000 Sobic003G323000 Sobic008G013100--Sobic003G323000 Sobic004G313800 Sobic004G313800 Sobic008G013100--Sobic004G313800 Sobic005G187100 Sobic005G187100 Sobic008G013100--Sobic005G187100 Sobic003G105600--Sobic009G186400 Sobic003G105600--Sobic001G326000 Sobic002G077500 Sobic002G077500 Sobic003G105600--Sobic002G077500 Sobic003G105600--Sobic008G013100 Sobic003G105600--Sobic009G022700 Sobic007G156300 Sobic007G156300 Sobic003G105600--Sobic007G156300 Sobic003G105600--Sobic006G059900 SobicK043500 SobicK043500 Sobic003G105600--SobicK043500 Sobic005G112066 Sobic005G112066 Sobic003G105600--Sobic005G112066 Sobic006G059900--Sobic003G438700 Sobic006G059900--Sobic004G313800 Sobic006G059900--Sobic008G013100 Sobic005G223200 Sobic005G223200 Sobic006G059900--Sobic005G223200 Sobic006G059900--Sobic003G105600 Sobic006G059900--Sobic001G326000 Sobic006G154300 Sobic006G154300 Sobic006G059900--Sobic006G154300 Sobic006G059900--Sobic007G156300 Sobic009G010150 Sobic009G010150 Sobic006G059900--Sobic009G010150 Sobic009G022700--Sobic003G105600 Sobic009G022700--Sobic008G013100 Sobic009G022700--Sobic009G186400 Sobic009G022700--Sobic001G326000 Sobic009G022700--Sobic006G059900 Sobic009G022700--Sobic002G077500 Sobic009G022700--Sobic003G438700 Sobic009G022700--Sobic004G313800 Sobic003G350900 Sobic003G350900 Sobic009G022700--Sobic003G350900 Sobic001G326000--Sobic002G077500 Sobic001G326000--Sobic007G156300 Sobic001G326000--Sobic005G112066 Sobic001G326000--Sobic009G186400 Sobic001G326000--Sobic003G105600 Sobic006G031600 Sobic006G031600 Sobic001G326000--Sobic006G031600 Sobic001G326000--Sobic004G313800 Sobic001G326000--Sobic005G223200 Sobic002G344900 Sobic002G344900 Sobic001G326000--Sobic002G344900 Sobic003G438700--Sobic004G313800 Sobic003G438700--Sobic006G154300 Sobic003G438700--Sobic009G010150 Sobic002G274900 Sobic002G274900 Sobic003G438700--Sobic002G274900 Sobic007G001600 Sobic007G001600 Sobic003G438700--Sobic007G001600 Sobic003G438700--Sobic006G059900 Sobic003G226000 Sobic003G226000 Sobic003G438700--Sobic003G226000 Sobic003G438700--Sobic005G223200 Sobic009G009900 Sobic009G009900 Sobic003G438700--Sobic009G009900 Sobic009G186400--Sobic002G077500 Sobic009G186400--SobicK043500 Sobic009G186400--Sobic003G105600 Sobic009G186400--Sobic001G326000 Sobic007G083300 Sobic007G083300 Sobic009G186400--Sobic007G083300 Sobic009G186400--Sobic005G112066 Sobic007G049400 Sobic007G049400 Sobic009G186400--Sobic007G049400 Sobic007G070700 Sobic007G070700 Sobic009G186400--Sobic007G070700 Sobic002G077600 Sobic002G077600 Sobic009G186400--Sobic002G077600 Sobic001G259300 Sobic001G259300 Sobic003G323000--Sobic001G259300 Sobic003G323000--Sobic008G013100 Sobic003G323000--Sobic003G105600 Sobic003G323000--Sobic003G350900 Sobic005G188000 Sobic005G188000 Sobic003G323000--Sobic005G188000 Sobic003G323000--Sobic009G022700 Sobic003G323000--Sobic009G186400 Sobic008G064000 Sobic008G064000 Sobic003G323000--Sobic008G064000 Sobic003G323000--Sobic006G059900 Sobic004G313800--Sobic003G438700 Sobic004G313800--Sobic006G154300 Sobic004G313800--Sobic009G010150 Sobic004G313800--Sobic005G223200 Sobic004G313800--Sobic009G009900 Sobic009G010000 Sobic009G010000 Sobic004G313800--Sobic009G010000 Sobic004G313800--Sobic007G001600 Sobic003G392500 Sobic003G392500 Sobic004G313800--Sobic003G392500 Sobic004G313800--Sobic007G156300 Sobic010G153800 Sobic010G153800 Sobic005G187100--Sobic010G153800 Sobic005G199101 Sobic005G199101 Sobic005G187100--Sobic005G199101 Sobic005G225000 Sobic005G225000 Sobic005G187100--Sobic005G225000 Sobic010G219300 Sobic010G219300 Sobic005G187100--Sobic010G219300 Sobic007G082900 Sobic007G082900 Sobic005G187100--Sobic007G082900 Sobic002G091800 Sobic002G091800 Sobic005G187100--Sobic002G091800 Sobic005G187100--Sobic002G344900 Sobic005G153600 Sobic005G153600 Sobic005G187100--Sobic005G153600 Sobic010G148600 Sobic010G148600 Sobic005G187100--Sobic010G148600
Octagon: transcription factors


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