Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G105600.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PCU7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
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Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G143633 - -
2 Sobic.005G048950 - -
3 Sobic.006G038700 - -
4 Sobic.003G167200 - -
5 Sobic.010G049700 expressed protein -
6 Sobic.004G116050 - -
7 Sobic.001G117701 - -
8 Sobic.001G313150 - -
9 Sobic.008G007900 expressed protein -
10 Sobic.009G056900 acetyltransferase, GNAT family protein, expressed -
11 Sobic.001G075201 - -
12 Sobic.002G016000 OsFBL32 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
13 Sobic.002G066700 OsFBL33 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
14 Sobic.009G006700 vacuolar ATP synthase, putative, expressed K02155: ATPeV0C, V-type H+-transporting ATPase 16kDa proteolipid subunit
15 Sobic.005G201200 - -
16 Sobic.005G144500 glycosyltransferase, putative, expressed -
17 Sobic.002G361500 "domain confirmed by Pfam database, expression supported by NCBI EST database, expressed in leaf and root, expression induced by IAA and BR treatments"(PubMedID : 20499123)@Indole-acetic acid (IAA)-amido synthetase(PubMedID : 30367619)@OsGH3.8 - Probable indole-3-acetic acid-amido synthetase, expressed K14487: auxin responsive GH3 gene family
18 Sobic.001G093666 - -
19 Sobic.002G147400 homeodomain-related, putative, expressed -
20 Sobic.010G038000 ATP-binding region, ATPase-like domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G105600 Sobic008G105600 Sobic010G143633 Sobic010G143633 Sobic008G105600--Sobic010G143633 Sobic005G048950 Sobic005G048950 Sobic008G105600--Sobic005G048950 Sobic006G038700 Sobic006G038700 Sobic008G105600--Sobic006G038700 Sobic003G167200 Sobic003G167200 Sobic008G105600--Sobic003G167200 Sobic010G049700 Sobic010G049700 Sobic008G105600--Sobic010G049700 Sobic004G116050 Sobic004G116050 Sobic008G105600--Sobic004G116050 Sobic001G117701 Sobic001G117701 Sobic008G105600--Sobic001G117701 Sobic001G313150 Sobic001G313150 Sobic008G105600--Sobic001G313150 Sobic008G007900 Sobic008G007900 Sobic008G105600--Sobic008G007900 Sobic010G143633--Sobic008G105600 Sobic010G143633--Sobic005G048950 Sobic010G143633--Sobic010G049700 Sobic010G143633--Sobic004G116050 Sobic010G143633--Sobic006G038700 Sobic010G143633--Sobic001G117701 Sobic005G144500 Sobic005G144500 Sobic010G143633--Sobic005G144500 Sobic007G171700 Sobic007G171700 Sobic010G143633--Sobic007G171700 Sobic009G006700 Sobic009G006700 Sobic010G143633--Sobic009G006700 Sobic005G048950--Sobic010G143633 Sobic005G048950--Sobic008G105600 Sobic005G048950--Sobic010G049700 Sobic005G048950--Sobic004G116050 Sobic001G093666 Sobic001G093666 Sobic005G048950--Sobic001G093666 Sobic005G048950--Sobic006G038700 Sobic005G048950--Sobic003G167200 Sobic005G048950--Sobic007G171700 Sobic005G048950--Sobic001G117701 Sobic006G038700--Sobic009G006700 Sobic006G038700--Sobic001G117701 Sobic005G201200 Sobic005G201200 Sobic006G038700--Sobic005G201200 Sobic002G016000 Sobic002G016000 Sobic006G038700--Sobic002G016000 Sobic006G038700--Sobic008G105600 Sobic006G038700--Sobic010G143633 Sobic002G361500 Sobic002G361500 Sobic006G038700--Sobic002G361500 Sobic006G038700--Sobic005G144500 Sobic010G198400 Sobic010G198400 Sobic006G038700--Sobic010G198400 Sobic002G266600 Sobic002G266600 Sobic003G167200--Sobic002G266600 Sobic003G035001 Sobic003G035001 Sobic003G167200--Sobic003G035001 Sobic003G167200--Sobic008G105600 Sobic002G099866 Sobic002G099866 Sobic003G167200--Sobic002G099866 Sobic003G167200--Sobic008G007900 Sobic001G264600 Sobic001G264600 Sobic003G167200--Sobic001G264600 Sobic009G056900 Sobic009G056900 Sobic003G167200--Sobic009G056900 Sobic003G167200--Sobic001G313150 Sobic009G132400 Sobic009G132400 Sobic003G167200--Sobic009G132400 Sobic010G049700--Sobic004G116050 Sobic010G049700--Sobic005G144500 Sobic010G049700--Sobic010G143633 Sobic006G064450 Sobic006G064450 Sobic010G049700--Sobic006G064450 Sobic001G345500 Sobic001G345500 Sobic010G049700--Sobic001G345500 Sobic010G049700--Sobic009G006700 Sobic007G219601 Sobic007G219601 Sobic010G049700--Sobic007G219601 Sobic010G049700--Sobic006G038700 Sobic007G094700 Sobic007G094700 Sobic010G049700--Sobic007G094700 Sobic004G116050--Sobic010G049700 Sobic004G116050--Sobic010G143633 Sobic004G116050--Sobic005G144500 Sobic004G116050--Sobic001G117701 Sobic004G116050--Sobic006G038700 Sobic004G116050--Sobic001G345500 Sobic004G116050--Sobic006G064450 Sobic004G116050--Sobic009G006700 Sobic004G116050--Sobic008G105600 Sobic001G117701--Sobic006G038700 Sobic001G117701--Sobic009G006700 Sobic001G117701--Sobic004G116050 Sobic001G117701--Sobic005G144500 Sobic006G254400 Sobic006G254400 Sobic001G117701--Sobic006G254400 Sobic010G038000 Sobic010G038000 Sobic001G117701--Sobic010G038000 Sobic001G117701--Sobic010G198400 Sobic002G424200 Sobic002G424200 Sobic001G117701--Sobic002G424200 Sobic001G117701--Sobic002G016000 Sobic001G313150--Sobic008G105600 Sobic001G313150--Sobic003G167200 Sobic001G313150--Sobic006G038700 Sobic004G155700 Sobic004G155700 Sobic001G313150--Sobic004G155700 Sobic001G313150--Sobic010G143633 Sobic001G313150--Sobic009G056900 Sobic001G392700 Sobic001G392700 Sobic001G313150--Sobic001G392700 Sobic008G154600 Sobic008G154600 Sobic001G313150--Sobic008G154600 Sobic002G066700 Sobic002G066700 Sobic001G313150--Sobic002G066700 Sobic008G007900--Sobic003G167200 Sobic008G007900--Sobic008G105600 Sobic008G007900--Sobic002G266600 Sobic008G007900--Sobic003G035001 Sobic008G007900--Sobic010G143633 Sobic008G007900--Sobic001G264600 Sobic008G007900--Sobic009G056900 Sobic008G007900--Sobic002G066700 Sobic008G007900--Sobic005G048950
Octagon: transcription factors


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