Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G007900.5,Sobic.008G007900.3,Sobic.008G007900.2,Sobic.008G007900.4
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PAP2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g18070.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G167200 - -
2 Sobic.008G105600 - -
3 Sobic.002G266600 - K03006: RPB1, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1
4 Sobic.003G035001 - -
5 Sobic.010G143633 - -
6 Sobic.001G264600 - -
7 Sobic.009G056900 acetyltransferase, GNAT family protein, expressed -
8 Sobic.002G066700 OsFBL33 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
9 Sobic.005G048950 - -
10 Sobic.002G099866 - -
11 Sobic.001G392700 AP2 domain containing protein, expressed K09285: OVM, AP2-like factor, ANT lineage
12 Sobic.005G206800 expressed protein -
13 Sobic.006G038700 - -
14 Sobic.001G313150 - -
15 Sobic.008G064300 - -
16 Sobic.001G075201 - -
17 Sobic.004G027200 dnaJ domain containing protein, expressed K09510: DnaJ homolog subfamily B member 4
18 Sobic.001G452100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@caleosin related protein, putative, expressed K17991: peroxygenase
19 Sobic.002G016000 OsFBL32 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
20 Sobic.007G086701 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G007900 Sobic008G007900 Sobic003G167200 Sobic003G167200 Sobic008G007900--Sobic003G167200 Sobic008G105600 Sobic008G105600 Sobic008G007900--Sobic008G105600 Sobic002G266600 Sobic002G266600 Sobic008G007900--Sobic002G266600 Sobic003G035001 Sobic003G035001 Sobic008G007900--Sobic003G035001 Sobic010G143633 Sobic010G143633 Sobic008G007900--Sobic010G143633 Sobic001G264600 Sobic001G264600 Sobic008G007900--Sobic001G264600 Sobic009G056900 Sobic009G056900 Sobic008G007900--Sobic009G056900 Sobic002G066700 Sobic002G066700 Sobic008G007900--Sobic002G066700 Sobic005G048950 Sobic005G048950 Sobic008G007900--Sobic005G048950 Sobic003G167200--Sobic002G266600 Sobic003G167200--Sobic003G035001 Sobic003G167200--Sobic008G105600 Sobic002G099866 Sobic002G099866 Sobic003G167200--Sobic002G099866 Sobic003G167200--Sobic008G007900 Sobic003G167200--Sobic001G264600 Sobic003G167200--Sobic009G056900 Sobic001G313150 Sobic001G313150 Sobic003G167200--Sobic001G313150 Sobic009G132400 Sobic009G132400 Sobic003G167200--Sobic009G132400 Sobic008G105600--Sobic010G143633 Sobic008G105600--Sobic005G048950 Sobic006G038700 Sobic006G038700 Sobic008G105600--Sobic006G038700 Sobic008G105600--Sobic003G167200 Sobic010G049700 Sobic010G049700 Sobic008G105600--Sobic010G049700 Sobic004G116050 Sobic004G116050 Sobic008G105600--Sobic004G116050 Sobic001G117701 Sobic001G117701 Sobic008G105600--Sobic001G117701 Sobic008G105600--Sobic001G313150 Sobic008G105600--Sobic008G007900 Sobic002G266600--Sobic001G264600 Sobic002G266600--Sobic002G099866 Sobic002G266600--Sobic003G167200 Sobic007G086701 Sobic007G086701 Sobic002G266600--Sobic007G086701 Sobic001G261529 Sobic001G261529 Sobic002G266600--Sobic001G261529 Sobic002G266600--Sobic003G035001 Sobic002G266600--Sobic002G066700 Sobic006G018751 Sobic006G018751 Sobic002G266600--Sobic006G018751 Sobic005G083280 Sobic005G083280 Sobic002G266600--Sobic005G083280 Sobic003G035001--Sobic003G167200 Sobic003G035001--Sobic002G266600 Sobic003G035001--Sobic002G099866 Sobic001G509100 Sobic001G509100 Sobic003G035001--Sobic001G509100 Sobic003G035001--Sobic001G264600 Sobic003G035001--Sobic001G261529 Sobic001G452100 Sobic001G452100 Sobic003G035001--Sobic001G452100 Sobic003G035001--Sobic008G007900 Sobic009G234500 Sobic009G234500 Sobic003G035001--Sobic009G234500 Sobic010G143633--Sobic008G105600 Sobic010G143633--Sobic005G048950 Sobic010G143633--Sobic010G049700 Sobic010G143633--Sobic004G116050 Sobic010G143633--Sobic006G038700 Sobic010G143633--Sobic001G117701 Sobic005G144500 Sobic005G144500 Sobic010G143633--Sobic005G144500 Sobic007G171700 Sobic007G171700 Sobic010G143633--Sobic007G171700 Sobic009G006700 Sobic009G006700 Sobic010G143633--Sobic009G006700 Sobic001G264600--Sobic007G086701 Sobic001G264600--Sobic002G266600 Sobic001G264600--Sobic006G018751 Sobic001G264600--Sobic001G261529 Sobic001G264600--Sobic005G083280 Sobic001G264600--Sobic002G099866 Sobic001G264600--Sobic002G066700 Sobic004G322901 Sobic004G322901 Sobic001G264600--Sobic004G322901 Sobic001G264600--Sobic003G167200 Sobic009G056900--Sobic002G066700 Sobic001G392700 Sobic001G392700 Sobic009G056900--Sobic001G392700 Sobic002G147400 Sobic002G147400 Sobic009G056900--Sobic002G147400 Sobic001G075201 Sobic001G075201 Sobic009G056900--Sobic001G075201 Sobic005G201200 Sobic005G201200 Sobic009G056900--Sobic005G201200 Sobic009G056900--Sobic006G038700 Sobic002G016000 Sobic002G016000 Sobic009G056900--Sobic002G016000 Sobic009G056900--Sobic002G266600 Sobic009G056900--Sobic003G167200 Sobic002G066700--Sobic009G056900 Sobic002G066700--Sobic002G147400 Sobic002G066700--Sobic001G392700 Sobic002G066700--Sobic005G201200 Sobic002G066700--Sobic007G086701 Sobic002G066700--Sobic006G038700 Sobic002G066700--Sobic001G264600 Sobic005G206800 Sobic005G206800 Sobic002G066700--Sobic005G206800 Sobic002G066700--Sobic002G016000 Sobic005G048950--Sobic010G143633 Sobic005G048950--Sobic008G105600 Sobic005G048950--Sobic010G049700 Sobic005G048950--Sobic004G116050 Sobic001G093666 Sobic001G093666 Sobic005G048950--Sobic001G093666 Sobic005G048950--Sobic006G038700 Sobic005G048950--Sobic003G167200 Sobic005G048950--Sobic007G171700 Sobic005G048950--Sobic001G117701
Octagon: transcription factors


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