Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G006700.1
Synonym Sb09g000810, AVA-P4
Functional annotation vacuolar ATP synthase, putative, expressed
UniProt A0A1B6P5V5
Pfam PF00137
Panther DB PTHR10263 PTHR10263:SF19
NCBI CDD KOG0232; Vacuolar H+-ATPase V0 sector, subunits c/c'
KEGG Orthology K02155; ATPeV0C, V-type H+-transporting ATPase 16kDa proteolipid subunit
Gene Ontology GO:0015078; proton transmembrane transporter activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G75630 : vacuolar H+-pumping ATPase 16 kDa proteolipid subunit 4
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g07140.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.008G007800 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G006700 Sobic009G006700 Sobic007G219601 Sobic007G219601 Sobic009G006700--Sobic007G219601 Sobic007G094700 Sobic007G094700 Sobic009G006700--Sobic007G094700 Sobic004G203150 Sobic004G203150 Sobic009G006700--Sobic004G203150 Sobic009G048700 Sobic009G048700 Sobic009G006700--Sobic009G048700 Sobic009G008000 Sobic009G008000 Sobic009G006700--Sobic009G008000 Sobic005G144500 Sobic005G144500 Sobic009G006700--Sobic005G144500 Sobic008G155700 Sobic008G155700 Sobic009G006700--Sobic008G155700 Sobic006G038700 Sobic006G038700 Sobic009G006700--Sobic006G038700 Sobic010G038000 Sobic010G038000 Sobic009G006700--Sobic010G038000 Sobic007G219601--Sobic007G094700 Sobic007G219601--Sobic004G203150 Sobic003G133600 Sobic003G133600 Sobic007G219601--Sobic003G133600 Sobic002G418300 Sobic002G418300 Sobic007G219601--Sobic002G418300 Sobic006G064450 Sobic006G064450 Sobic007G219601--Sobic006G064450 Sobic007G219601--Sobic008G155700 Sobic007G219601--Sobic009G008000 Sobic001G417700 Sobic001G417700 Sobic007G219601--Sobic001G417700 Sobic004G328200 Sobic004G328200 Sobic007G219601--Sobic004G328200 Sobic007G094700--Sobic004G203150 Sobic007G094700--Sobic007G219601 Sobic007G094700--Sobic003G133600 Sobic007G094700--Sobic002G418300 Sobic007G094700--Sobic001G417700 Sobic007G094700--Sobic004G328200 Sobic007G094700--Sobic008G155700 Sobic007G094700--Sobic009G008000 Sobic001G029300 Sobic001G029300 Sobic007G094700--Sobic001G029300 Sobic004G203150--Sobic007G094700 Sobic004G203150--Sobic007G219601 Sobic004G203150--Sobic003G133600 Sobic004G203150--Sobic002G418300 Sobic004G203150--Sobic001G029300 Sobic004G203150--Sobic004G328200 Sobic004G203150--Sobic001G417700 Sobic004G203150--Sobic009G008000 Sobic004G203150--Sobic008G155700 Sobic009G048700--Sobic009G008000 Sobic009G048700--Sobic001G417700 Sobic009G048700--Sobic008G155700 Sobic009G145000 Sobic009G145000 Sobic009G048700--Sobic009G145000 Sobic009G048700--Sobic007G094700 Sobic006G199500 Sobic006G199500 Sobic009G048700--Sobic006G199500 Sobic009G048700--Sobic004G203150 Sobic009G048700--Sobic002G418300 Sobic009G048700--Sobic007G219601 Sobic009G008000--Sobic009G048700 Sobic009G008000--Sobic007G094700 Sobic009G008000--Sobic004G203150 Sobic009G008000--Sobic001G417700 Sobic009G008000--Sobic009G145000 Sobic009G008000--Sobic007G219601 Sobic009G008000--Sobic008G155700 Sobic009G008000--Sobic002G418300 Sobic002G189500 Sobic002G189500 Sobic009G008000--Sobic002G189500 Sobic005G144500--Sobic006G064450 Sobic005G144500--Sobic007G219601 Sobic005G144500--Sobic007G094700 Sobic005G144500--Sobic008G155700 Sobic005G144500--Sobic009G006700 Sobic005G144500--Sobic003G133600 Sobic005G144500--Sobic004G203150 Sobic010G049700 Sobic010G049700 Sobic005G144500--Sobic010G049700 Sobic005G144500--Sobic010G038000 Sobic008G155700--Sobic007G094700 Sobic008G155700--Sobic001G417700 Sobic008G155700--Sobic002G418300 Sobic008G155700--Sobic004G203150 Sobic008G155700--Sobic009G048700 Sobic008G155700--Sobic007G219601 Sobic008G155700--Sobic003G133600 Sobic008G155700--Sobic009G008000 Sobic008G155700--Sobic009G145000 Sobic006G038700--Sobic009G006700 Sobic001G117701 Sobic001G117701 Sobic006G038700--Sobic001G117701 Sobic005G201200 Sobic005G201200 Sobic006G038700--Sobic005G201200 Sobic002G016000 Sobic002G016000 Sobic006G038700--Sobic002G016000 Sobic008G105600 Sobic008G105600 Sobic006G038700--Sobic008G105600 Sobic010G143633 Sobic010G143633 Sobic006G038700--Sobic010G143633 Sobic002G361500 Sobic002G361500 Sobic006G038700--Sobic002G361500 Sobic006G038700--Sobic005G144500 Sobic010G198400 Sobic010G198400 Sobic006G038700--Sobic010G198400 Sobic010G038000--Sobic009G006700 Sobic010G038000--Sobic009G048700 Sobic010G038000--Sobic007G219601 Sobic010G038000--Sobic010G198400 Sobic010G038000--Sobic001G417700 Sobic004G020200 Sobic004G020200 Sobic010G038000--Sobic004G020200 Sobic010G038000--Sobic007G094700 Sobic002G243400 Sobic002G243400 Sobic010G038000--Sobic002G243400 Sobic010G038000--Sobic008G155700
Octagon: transcription factors


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