Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G173000.1
Synonym Sb07g024530
Functional annotation transmembrane 9 superfamily member, putative, expressed
UniProt C5YNB2
Pfam PF02990
Panther DB PTHR10766 PTHR10766:SF51
NCBI CDD -
KEGG Orthology K17086; transmembrane 9 superfamily member 2/4
Gene Ontology GO:0016021; integral component of membrane


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G10840 : Endomembrane protein 70 protein family
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g38530.1 : transmembrane 9 superfamily member, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a005641 , Zm00025a047903 , Zm00025a005645 , Zm00025a042031 , Zm00025a014550 , Zm00025a031240
Brachypodium -
Barley HORVU5Hr1G088680.1 , HORVU5Hr1G088680.3 , HORVU5Hr1G088680.13 , HORVU5Hr1G088680.12 , HORVU5Hr1G088680.9 , HORVU5Hr1G088680.8 , HORVU5Hr1G088680.5 , HORVU5Hr1G088680.4 , HORVU5Hr1G088680.7 , HORVU5Hr1G088680.6 , HORVU5Hr1G088680.2 , HORVU5Hr1G088680.11 , HORVU5Hr1G088680.10
Wheat TraesCS5A02G359800 , TraesCS5A02G359800 , TraesCS5D02G369000 , TraesCS5B02G362100 , TraesCS5B02G362100
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.007G173000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic007G173000 Sobic007G173000 Sobic006G071628 Sobic006G071628 Sobic007G173000--Sobic006G071628 Sobic001G051300 Sobic001G051300 Sobic007G173000--Sobic001G051300 Sobic001G196000 Sobic001G196000 Sobic007G173000--Sobic001G196000 Sobic007G139500 Sobic007G139500 Sobic007G173000--Sobic007G139500 Sobic005G129201 Sobic005G129201 Sobic007G173000--Sobic005G129201 Sobic002G232400 Sobic002G232400 Sobic007G173000--Sobic002G232400 Sobic009G061000 Sobic009G061000 Sobic007G173000--Sobic009G061000 Sobic002G370400 Sobic002G370400 Sobic007G173000--Sobic002G370400 Sobic009G256700 Sobic009G256700 Sobic007G173000--Sobic009G256700 Sobic009G052100 Sobic009G052100 Sobic006G071628--Sobic009G052100 Sobic006G071628--Sobic001G051300 Sobic006G084300 Sobic006G084300 Sobic006G071628--Sobic006G084300 Sobic006G071628--Sobic007G173000 Sobic010G250800 Sobic010G250800 Sobic006G071628--Sobic010G250800 Sobic001G199500 Sobic001G199500 Sobic006G071628--Sobic001G199500 Sobic004G156200 Sobic004G156200 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Octagon: transcription factors


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