Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G057500.1
Synonym Sb05g004640
Functional annotation Leucine Rich Repeat family protein, expressed
UniProt A0A1Z5RHS7
Pfam PF00560
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF530
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G19050 : NB-ARC domain-containing disease resistance protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g32940.1 : Leucine Rich Repeat family protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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18 Sobic.001G355850 - -
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20 Sobic.001G209000 secretory protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G057500 Sobic005G057500 Sobic003G008400 Sobic003G008400 Sobic005G057500--Sobic003G008400 Sobic003G254400 Sobic003G254400 Sobic005G057500--Sobic003G254400 Sobic005G080075 Sobic005G080075 Sobic005G057500--Sobic005G080075 Sobic003G318600 Sobic003G318600 Sobic005G057500--Sobic003G318600 Sobic001G100650 Sobic001G100650 Sobic005G057500--Sobic001G100650 Sobic010G064050 Sobic010G064050 Sobic005G057500--Sobic010G064050 Sobic008G191800 Sobic008G191800 Sobic005G057500--Sobic008G191800 Sobic003G360500 Sobic003G360500 Sobic005G057500--Sobic003G360500 Sobic002G082350 Sobic002G082350 Sobic005G057500--Sobic002G082350 Sobic003G008400--Sobic005G080075 Sobic003G008400--Sobic003G254400 Sobic003G008400--Sobic001G100650 Sobic003G008400--Sobic010G064050 Sobic003G008400--Sobic003G318600 Sobic003G008400--Sobic002G082350 Sobic003G008400--Sobic003G360500 Sobic009G073200 Sobic009G073200 Sobic003G008400--Sobic009G073200 Sobic001G413400 Sobic001G413400 Sobic003G008400--Sobic001G413400 Sobic003G254400--Sobic003G008400 Sobic003G254400--Sobic005G080075 Sobic003G254400--Sobic001G100650 Sobic003G254400--Sobic010G064050 Sobic003G254400--Sobic003G318600 Sobic003G254400--Sobic002G082350 Sobic003G254400--Sobic003G360500 Sobic003G254400--Sobic009G073200 Sobic003G254400--Sobic001G413400 Sobic005G080075--Sobic001G100650 Sobic005G080075--Sobic010G064050 Sobic005G080075--Sobic003G008400 Sobic005G080075--Sobic002G082350 Sobic005G080075--Sobic003G254400 Sobic005G080075--Sobic009G073200 Sobic005G080075--Sobic003G318600 Sobic005G080075--Sobic003G360500 Sobic005G080075--Sobic001G413400 Sobic003G318600--Sobic003G008400 Sobic003G318600--Sobic003G254400 Sobic003G318600--Sobic005G080075 Sobic003G318600--Sobic001G100650 Sobic003G318600--Sobic010G064050 Sobic003G318600--Sobic002G082350 Sobic003G318600--Sobic003G360500 Sobic003G318600--Sobic009G073200 Sobic003G318600--Sobic001G413400 Sobic001G100650--Sobic001G100650 Sobic001G100650--Sobic005G080075 Sobic001G100650--Sobic002G082350 Sobic001G100650--Sobic003G008400 Sobic001G100650--Sobic003G254400 Sobic001G100650--Sobic009G073200 Sobic001G100650--Sobic003G318600 Sobic001G100650--Sobic003G360500 Sobic002G313850 Sobic002G313850 Sobic001G100650--Sobic002G313850 Sobic010G064050--Sobic001G100650 Sobic010G064050--Sobic005G080075 Sobic010G064050--Sobic002G082350 Sobic010G064050--Sobic003G008400 Sobic010G064050--Sobic003G254400 Sobic010G064050--Sobic009G073200 Sobic010G064050--Sobic003G318600 Sobic010G064050--Sobic003G360500 Sobic010G064050--Sobic002G313850 Sobic008G191800--Sobic002G082350 Sobic008G191800--Sobic010G064050 Sobic008G191800--Sobic001G100650 Sobic008G191800--Sobic005G080075 Sobic008G191800--Sobic003G008400 Sobic008G191800--Sobic009G073200 Sobic008G191800--Sobic003G360500 Sobic008G191800--Sobic003G254400 Sobic008G191800--Sobic003G318600 Sobic003G360500--Sobic003G008400 Sobic003G360500--Sobic005G080075 Sobic003G360500--Sobic003G254400 Sobic003G360500--Sobic001G100650 Sobic003G360500--Sobic010G064050 Sobic003G360500--Sobic003G318600 Sobic003G360500--Sobic002G082350 Sobic003G360500--Sobic009G073200 Sobic003G360500--Sobic008G191800 Sobic002G082350--Sobic010G064050 Sobic002G082350--Sobic001G100650 Sobic002G082350--Sobic005G080075 Sobic002G082350--Sobic003G008400 Sobic002G082350--Sobic009G073200 Sobic002G082350--Sobic003G254400 Sobic002G082350--Sobic008G191800 Sobic002G082350--Sobic002G313850 Sobic007G145300 Sobic007G145300 Sobic002G082350--Sobic007G145300
Octagon: transcription factors


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