Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G254400.1
Synonym Sb03g030960
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6Q5B4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g48430.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G008400 acetyltransferase, GNAT family protein, expressed -
2 Sobic.005G080075 - -
3 Sobic.001G100650 - -
4 Sobic.010G064050 - -
5 Sobic.003G318600 - -
6 Sobic.002G082350 - -
7 Sobic.003G360500 glycosyl transferase, putative, expressed K00750: GYG1, glycogenin
8 Sobic.009G073200 expressed protein -
9 Sobic.001G413400 matrix attachment region binding protein, putative, expressed -
10 Sobic.002G313850 - -
11 Sobic.008G191800 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
12 Sobic.005G057500 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
13 Sobic.001G101650 - -
14 Sobic.009G190100 expressed protein -
15 Sobic.010G123000 - -
16 Sobic.007G145300 zinc knuckle family protein, expressed -
17 Sobic.007G121800 histone-lysine N-methyltransferase, putative, expressed K11420: [histone H3]-lysine9 N-trimethyltransferase EHMT
18 Sobic.009G197350 - -
19 Sobic.009G156700 protein transport protein, putative, expressed -
20 Sobic.010G263151 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G254400 Sobic003G254400 Sobic003G008400 Sobic003G008400 Sobic003G254400--Sobic003G008400 Sobic005G080075 Sobic005G080075 Sobic003G254400--Sobic005G080075 Sobic001G100650 Sobic001G100650 Sobic003G254400--Sobic001G100650 Sobic010G064050 Sobic010G064050 Sobic003G254400--Sobic010G064050 Sobic003G318600 Sobic003G318600 Sobic003G254400--Sobic003G318600 Sobic002G082350 Sobic002G082350 Sobic003G254400--Sobic002G082350 Sobic003G360500 Sobic003G360500 Sobic003G254400--Sobic003G360500 Sobic009G073200 Sobic009G073200 Sobic003G254400--Sobic009G073200 Sobic001G413400 Sobic001G413400 Sobic003G254400--Sobic001G413400 Sobic003G008400--Sobic005G080075 Sobic003G008400--Sobic003G254400 Sobic003G008400--Sobic001G100650 Sobic003G008400--Sobic010G064050 Sobic003G008400--Sobic003G318600 Sobic003G008400--Sobic002G082350 Sobic003G008400--Sobic003G360500 Sobic003G008400--Sobic009G073200 Sobic003G008400--Sobic001G413400 Sobic005G080075--Sobic001G100650 Sobic005G080075--Sobic010G064050 Sobic005G080075--Sobic003G008400 Sobic005G080075--Sobic002G082350 Sobic005G080075--Sobic003G254400 Sobic005G080075--Sobic009G073200 Sobic005G080075--Sobic003G318600 Sobic005G080075--Sobic003G360500 Sobic005G080075--Sobic001G413400 Sobic001G100650--Sobic001G100650 Sobic001G100650--Sobic005G080075 Sobic001G100650--Sobic002G082350 Sobic001G100650--Sobic003G008400 Sobic001G100650--Sobic003G254400 Sobic001G100650--Sobic009G073200 Sobic001G100650--Sobic003G318600 Sobic001G100650--Sobic003G360500 Sobic002G313850 Sobic002G313850 Sobic001G100650--Sobic002G313850 Sobic010G064050--Sobic001G100650 Sobic010G064050--Sobic005G080075 Sobic010G064050--Sobic002G082350 Sobic010G064050--Sobic003G008400 Sobic010G064050--Sobic003G254400 Sobic010G064050--Sobic009G073200 Sobic010G064050--Sobic003G318600 Sobic010G064050--Sobic003G360500 Sobic010G064050--Sobic002G313850 Sobic003G318600--Sobic003G008400 Sobic003G318600--Sobic003G254400 Sobic003G318600--Sobic005G080075 Sobic003G318600--Sobic001G100650 Sobic003G318600--Sobic010G064050 Sobic003G318600--Sobic002G082350 Sobic003G318600--Sobic003G360500 Sobic003G318600--Sobic009G073200 Sobic003G318600--Sobic001G413400 Sobic002G082350--Sobic010G064050 Sobic002G082350--Sobic001G100650 Sobic002G082350--Sobic005G080075 Sobic002G082350--Sobic003G008400 Sobic002G082350--Sobic009G073200 Sobic002G082350--Sobic003G254400 Sobic008G191800 Sobic008G191800 Sobic002G082350--Sobic008G191800 Sobic002G082350--Sobic002G313850 Sobic007G145300 Sobic007G145300 Sobic002G082350--Sobic007G145300 Sobic003G360500--Sobic003G008400 Sobic003G360500--Sobic005G080075 Sobic003G360500--Sobic003G254400 Sobic003G360500--Sobic001G100650 Sobic003G360500--Sobic010G064050 Sobic003G360500--Sobic003G318600 Sobic003G360500--Sobic002G082350 Sobic003G360500--Sobic009G073200 Sobic003G360500--Sobic008G191800 Sobic009G073200--Sobic010G064050 Sobic009G073200--Sobic001G100650 Sobic009G073200--Sobic005G080075 Sobic009G073200--Sobic002G082350 Sobic009G073200--Sobic003G008400 Sobic009G073200--Sobic003G254400 Sobic009G073200--Sobic003G318600 Sobic009G073200--Sobic003G360500 Sobic009G073200--Sobic002G313850 Sobic001G413400--Sobic005G080075 Sobic001G413400--Sobic001G100650 Sobic001G413400--Sobic010G064050 Sobic001G413400--Sobic003G008400 Sobic001G413400--Sobic002G082350 Sobic001G413400--Sobic003G254400 Sobic001G413400--Sobic009G073200 Sobic001G413400--Sobic002G313850 Sobic001G413400--Sobic003G318600
Octagon: transcription factors


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