Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G208600.1
Synonym
Functional annotation glycine-rich protein, putative, expressed
UniProt A0A194YQT4
Pfam -
Panther DB PTHR35483 PTHR35483:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G43630 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g39340.1 : glycine-rich protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a021248 , Zm00025a031883
Brachypodium KQK00251 , KQK00252 , PNT68998
Barley HORVU2Hr1G084790.1
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G225600 - -
2 Sobic.001G384800 expressed protein -
3 Sobic.007G095500 expressed protein -
4 Sobic.001G202000 oxidoreductase, aldo/keto reductase family protein, putative, expressed -
5 Sobic.001G514100 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
6 Sobic.008G090900 expressed protein -
7 Sobic.001G099000 expressed protein -
8 Sobic.007G116100 thioredoxin, putative, expressed -
9 Sobic.004G255500 SET domain-containing protein, putative, expressed -
10 Sobic.004G003900 nitric oxide synthase 1, putative, expressed K13427: nitric-oxide synthase, plant
11 Sobic.008G067100 phosphomethylpyrimidine kinase/thiamin-phosphate pyrophosphorylase, putative, expressed K14153: hydroxymethylpyrimidine kinase / phosphomethylpyrimidine kinase / thiamine-phosphate diphosphorylase
12 Sobic.001G382800 ABC transporter, ATP-binding protein, putative, expressed K09013: Fe-S cluster assembly ATP-binding protein
13 Sobic.005G197300 GTP-binding protein, putative, expressed K03977: engA, GTPase
14 Sobic.001G003900 pentatricopeptide, putative, expressed -
15 Sobic.001G375000 OsClp5 - Putative Clp protease homologue, expressed -
16 Sobic.002G156100 phosphoglycerate mutase, putative, expressed -
17 Sobic.007G013000 transferase family protein, putative, expressed -
18 Sobic.003G128400 OsClp1 - Putative Clp protease homologue, expressed K01358: clpP, ATP-dependent Clp protease, protease subunit
19 Sobic.001G494500 kinase, pfkB family, putative, expressed -
20 Sobic.002G081500 glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative, expressed K00006: glycerol-3-phosphate dehydrogenase (NAD+)


Gene co-expression network
sample Sobic004G208600 Sobic004G208600 Sobic004G225600 Sobic004G225600 Sobic004G208600--Sobic004G225600 Sobic001G384800 Sobic001G384800 Sobic004G208600--Sobic001G384800 Sobic007G095500 Sobic007G095500 Sobic004G208600--Sobic007G095500 Sobic001G202000 Sobic001G202000 Sobic004G208600--Sobic001G202000 Sobic001G514100 Sobic001G514100 Sobic004G208600--Sobic001G514100 Sobic008G090900 Sobic008G090900 Sobic004G208600--Sobic008G090900 Sobic001G099000 Sobic001G099000 Sobic004G208600--Sobic001G099000 Sobic007G116100 Sobic007G116100 Sobic004G208600--Sobic007G116100 Sobic004G255500 Sobic004G255500 Sobic004G208600--Sobic004G255500 Sobic001G022500 Sobic001G022500 Sobic004G225600--Sobic001G022500 Sobic004G225600--Sobic004G208600 Sobic003G162800 Sobic003G162800 Sobic004G225600--Sobic003G162800 Sobic004G225600--Sobic001G099000 Sobic004G225600--Sobic007G095500 Sobic006G058100 Sobic006G058100 Sobic004G225600--Sobic006G058100 Sobic001G375000 Sobic001G375000 Sobic004G225600--Sobic001G375000 Sobic003G434700 Sobic003G434700 Sobic004G225600--Sobic003G434700 Sobic005G184300 Sobic005G184300 Sobic004G225600--Sobic005G184300 Sobic001G384800--Sobic004G208600 Sobic007G013000 Sobic007G013000 Sobic001G384800--Sobic007G013000 Sobic001G495300 Sobic001G495300 Sobic001G384800--Sobic001G495300 Sobic002G081500 Sobic002G081500 Sobic001G384800--Sobic002G081500 Sobic001G384800--Sobic001G202000 Sobic005G084000 Sobic005G084000 Sobic001G384800--Sobic005G084000 Sobic001G384800--Sobic001G099000 Sobic002G109000 Sobic002G109000 Sobic001G384800--Sobic002G109000 Sobic001G489800 Sobic001G489800 Sobic001G384800--Sobic001G489800 Sobic008G067100 Sobic008G067100 Sobic007G095500--Sobic008G067100 Sobic007G095500--Sobic004G208600 Sobic007G095500--Sobic004G225600 Sobic001G382800 Sobic001G382800 Sobic007G095500--Sobic001G382800 Sobic002G293600 Sobic002G293600 Sobic007G095500--Sobic002G293600 Sobic002G343400 Sobic002G343400 Sobic007G095500--Sobic002G343400 Sobic007G095500--Sobic008G090900 Sobic001G494500 Sobic001G494500 Sobic007G095500--Sobic001G494500 Sobic007G095500--Sobic006G058100 Sobic001G202000--Sobic004G208600 Sobic001G261573 Sobic001G261573 Sobic001G202000--Sobic001G261573 Sobic001G202000--Sobic001G494500 Sobic001G202000--Sobic001G384800 Sobic003G128400 Sobic003G128400 Sobic001G202000--Sobic003G128400 Sobic001G202000--Sobic007G013000 Sobic003G045300 Sobic003G045300 Sobic001G202000--Sobic003G045300 Sobic004G020800 Sobic004G020800 Sobic001G202000--Sobic004G020800 Sobic001G202000--Sobic004G225600 Sobic001G514100--Sobic003G162800 Sobic001G281500 Sobic001G281500 Sobic001G514100--Sobic001G281500 Sobic003G327200 Sobic003G327200 Sobic001G514100--Sobic003G327200 Sobic005G197300 Sobic005G197300 Sobic001G514100--Sobic005G197300 Sobic001G514100--Sobic001G375000 Sobic001G514100--Sobic003G128400 Sobic001G514100--Sobic001G494500 Sobic002G297400 Sobic002G297400 Sobic001G514100--Sobic002G297400 Sobic001G514100--Sobic001G382800 Sobic004G003900 Sobic004G003900 Sobic008G090900--Sobic004G003900 Sobic009G092900 Sobic009G092900 Sobic008G090900--Sobic009G092900 Sobic002G181132 Sobic002G181132 Sobic008G090900--Sobic002G181132 Sobic008G090900--Sobic001G382800 Sobic008G090900--Sobic008G067100 Sobic008G090900--Sobic003G045300 Sobic008G090900--Sobic001G375000 Sobic008G090900--Sobic003G128400 Sobic006G088000 Sobic006G088000 Sobic008G090900--Sobic006G088000 Sobic002G158800 Sobic002G158800 Sobic001G099000--Sobic002G158800 Sobic001G099000--Sobic005G184300 Sobic007G015300 Sobic007G015300 Sobic001G099000--Sobic007G015300 Sobic001G099000--Sobic002G081500 Sobic001G099000--Sobic004G255500 Sobic010G027200 Sobic010G027200 Sobic001G099000--Sobic010G027200 Sobic001G099000--Sobic002G109000 Sobic003G373300 Sobic003G373300 Sobic001G099000--Sobic003G373300 Sobic006G166000 Sobic006G166000 Sobic001G099000--Sobic006G166000 Sobic007G116100--Sobic010G027200 Sobic007G116100--Sobic001G281500 Sobic002G140000 Sobic002G140000 Sobic007G116100--Sobic002G140000 Sobic006G263800 Sobic006G263800 Sobic007G116100--Sobic006G263800 Sobic007G116100--Sobic001G099000 Sobic007G116100--Sobic007G015300 Sobic006G237100 Sobic006G237100 Sobic007G116100--Sobic006G237100 Sobic004G338300 Sobic004G338300 Sobic007G116100--Sobic004G338300 Sobic005G022800 Sobic005G022800 Sobic007G116100--Sobic005G022800 Sobic004G255500--Sobic001G099000 Sobic001G448600 Sobic001G448600 Sobic004G255500--Sobic001G448600 Sobic004G255500--Sobic005G022800 Sobic004G255500--Sobic001G281500 Sobic002G013700 Sobic002G013700 Sobic004G255500--Sobic002G013700 Sobic004G255500--Sobic010G027200 Sobic004G255500--Sobic005G184300 Sobic004G255500--Sobic002G140000 Sobic004G255500--Sobic007G015300
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.