Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G406300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W165
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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cDNA sequences
Sobic.003G406300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G176500 - -
2 Sobic.002G145101 - -
3 Sobic.007G096600 - -
4 Sobic.003G170100 - -
5 Sobic.005G110472 - -
6 Sobic.004G007100 - -
7 Sobic.003G200200 SIT4 phosphatase-associated protein domain containing protein, expressed K15501: PPP6R3, serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 3
8 Sobic.001G205200 expressed protein -
9 Sobic.005G144400 - -
10 Sobic.003G372700 expressed protein -
11 Sobic.003G268300 surp module family protein, putative, expressed -
12 Sobic.003G087400 - -
13 Sobic.003G148000 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K10666: E3 ubiquitin-protein ligase RNF5
14 Sobic.001G446900 arginyl-tRNA synthetase, putative, expressed -
15 Sobic.002G353600 expressed protein -
16 Sobic.009G127900 - -
17 Sobic.002G243900 - -
18 Sobic.002G297200 ZOS9-19 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
19 Sobic.003G438400 expressed protein -
20 Sobic.001G347300 splicing factor, arginine/serine-rich 16, putative, expressed K13168: splicing factor, arginine/serine-rich 16


Gene co-expression network
sample Sobic003G406300 Sobic003G406300 Sobic003G176500 Sobic003G176500 Sobic003G406300--Sobic003G176500 Sobic002G145101 Sobic002G145101 Sobic003G406300--Sobic002G145101 Sobic007G096600 Sobic007G096600 Sobic003G406300--Sobic007G096600 Sobic003G170100 Sobic003G170100 Sobic003G406300--Sobic003G170100 Sobic005G110472 Sobic005G110472 Sobic003G406300--Sobic005G110472 Sobic004G007100 Sobic004G007100 Sobic003G406300--Sobic004G007100 Sobic003G200200 Sobic003G200200 Sobic003G406300--Sobic003G200200 Sobic001G205200 Sobic001G205200 Sobic003G406300--Sobic001G205200 Sobic005G144400 Sobic005G144400 Sobic003G406300--Sobic005G144400 Sobic003G176500--Sobic007G096600 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic003G176500--Sobic002G243900 Sobic002G006900 Sobic002G006900 Sobic003G176500--Sobic002G006900 Sobic003G176500--Sobic005G144400 Sobic001G214300 Sobic001G214300 Sobic003G176500--Sobic001G214300 Sobic003G176500--Sobic003G200200 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic003G176500--Sobic007G178700 Sobic003G148000 Sobic003G148000 Sobic003G176500--Sobic003G148000 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic003G176500--Sobic003G268300 Sobic002G145101--Sobic003G148000 Sobic006G048500 Sobic006G048500 Sobic002G145101--Sobic006G048500 Sobic002G180666 Sobic002G180666 Sobic002G145101--Sobic002G180666 Sobic002G145101--Sobic002G243900 Sobic008G028700 Sobic008G028700 Sobic002G145101--Sobic008G028700 Sobic002G145101--Sobic004G007100 Sobic006G079400 Sobic006G079400 Sobic002G145101--Sobic006G079400 Sobic006G032500 Sobic006G032500 Sobic002G145101--Sobic006G032500 Sobic002G145101--Sobic005G144400 Sobic007G096600--Sobic002G243900 Sobic007G096600--Sobic003G268300 Sobic007G096600--Sobic003G176500 Sobic001G274200 Sobic001G274200 Sobic007G096600--Sobic001G274200 Sobic007G096600--Sobic003G200200 Sobic007G096600--Sobic005G144400 Sobic007G096600--Sobic003G148000 Sobic003G332800 Sobic003G332800 Sobic007G096600--Sobic003G332800 Sobic001G420200 Sobic001G420200 Sobic007G096600--Sobic001G420200 Sobic003G170100--Sobic005G110472 Sobic003G170100--Sobic003G268300 Sobic003G170100--Sobic003G200200 Sobic003G170100--Sobic007G096600 Sobic002G144933 Sobic002G144933 Sobic003G170100--Sobic002G144933 Sobic002G157000 Sobic002G157000 Sobic003G170100--Sobic002G157000 Sobic001G152320 Sobic001G152320 Sobic003G170100--Sobic001G152320 Sobic007G137900 Sobic007G137900 Sobic003G170100--Sobic007G137900 Sobic001G162300 Sobic001G162300 Sobic003G170100--Sobic001G162300 Sobic005G110472--Sobic003G170100 Sobic005G110472--Sobic007G096600 Sobic005G110472--Sobic003G268300 Sobic003G390400 Sobic003G390400 Sobic005G110472--Sobic003G390400 Sobic005G110472--Sobic002G243900 Sobic005G110472--Sobic003G200200 Sobic007G113800 Sobic007G113800 Sobic005G110472--Sobic007G113800 Sobic005G110472--Sobic007G137900 Sobic005G110472--Sobic003G176500 Sobic004G007100--Sobic006G048500 Sobic004G007100--Sobic002G243900 Sobic004G007100--Sobic005G144400 Sobic006G048600 Sobic006G048600 Sobic004G007100--Sobic006G048600 Sobic004G007100--Sobic007G178700 Sobic009G104201 Sobic009G104201 Sobic004G007100--Sobic009G104201 Sobic003G087400 Sobic003G087400 Sobic004G007100--Sobic003G087400 Sobic004G007100--Sobic002G006900 Sobic004G007100--Sobic002G180666 Sobic003G200200--Sobic002G157000 Sobic003G200200--Sobic002G006900 Sobic003G200200--Sobic003G268300 Sobic001G251700 Sobic001G251700 Sobic003G200200--Sobic001G251700 Sobic003G200200--Sobic007G096600 Sobic002G248400 Sobic002G248400 Sobic003G200200--Sobic002G248400 Sobic001G155000 Sobic001G155000 Sobic003G200200--Sobic001G155000 Sobic008G173900 Sobic008G173900 Sobic003G200200--Sobic008G173900 Sobic003G200200--Sobic003G170100 Sobic001G205200--Sobic006G048500 Sobic001G205200--Sobic002G006900 Sobic003G372700 Sobic003G372700 Sobic001G205200--Sobic003G372700 Sobic002G297200 Sobic002G297200 Sobic001G205200--Sobic002G297200 Sobic001G205200--Sobic004G007100 Sobic002G309600 Sobic002G309600 Sobic001G205200--Sobic002G309600 Sobic001G205200--Sobic003G087400 Sobic007G167500 Sobic007G167500 Sobic001G205200--Sobic007G167500 Sobic003G029700 Sobic003G029700 Sobic001G205200--Sobic003G029700 Sobic005G144400--Sobic006G048500 Sobic005G144400--Sobic003G148000 Sobic005G144400--Sobic002G243900 Sobic005G144400--Sobic007G096600 Sobic005G144400--Sobic004G007100 Sobic005G144400--Sobic001G214300 Sobic005G144400--Sobic003G176500 Sobic003G429650 Sobic003G429650 Sobic005G144400--Sobic003G429650 Sobic005G144400--Sobic007G178700
Octagon: transcription factors


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