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Transcriptome id Sobic.003G185250.1
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UniProt A0A1W0VXX6
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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1 Sobic.004G193800 hydrolase, alpha/beta fold family domain containing protein, expressed K14759: isochorismate synthase / 2-succinyl-5-enolpyruvyl-6-hydroxy-3-cyclohexene-1-carboxylate synthase / 2-succinyl-6-hydroxy-2,4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase / O-succinylbenzoate synthase
2 Sobic.001G045700 "CESA3-like homologous to the Arabidopsis, up-regulated in addition of GA3"(PubMedID : 26198258)@CESA2 - cellulose synthase, expressed K10999: cellulose synthase A
3 Sobic.002G060450 - -
4 Sobic.006G210200 zinc finger domain, LSD1 subclass family protein, expressed -
5 Sobic.001G454301 - -
6 Sobic.003G163100 expressed protein K08819: cyclin-dependent kinase 12/13
7 Sobic.006G006500 MBTB44 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
8 Sobic.003G023400 SCAR-like protein 2, putative, expressed -
9 Sobic.005G110523 - -
10 Sobic.004G169501 - -
11 Sobic.001G303675 - -
12 Sobic.008G117200 RING finger and CHY zinc finger domain-containing protein 1, putative, expressed K10144: RCHY1, RING finger and CHY zinc finger domain-containing protein 1
13 Sobic.002G090400 polygalacturonase, putative, expressed -
14 Sobic.002G049000 frigida, putative, expressed -
15 Sobic.009G045700 E3 ubiquitin-protein ligase SINA-like, putative, expressed K04506: E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1
16 Sobic.002G050500 type I inositol-1,4,5-trisphosphate 5-phosphatase, putative, expressed -
17 Sobic.002G140800 RNA pseudouridine synthase, putative, expressed -
18 Sobic.009G251300 endonuclease, putative, expressed -
19 Sobic.010G208500 - -
20 Sobic.006G210100 zinc finger domain, LSD1 subclass family protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G185250 Sobic003G185250 Sobic004G193800 Sobic004G193800 Sobic003G185250--Sobic004G193800 Sobic001G045700 Sobic001G045700 Sobic003G185250--Sobic001G045700 Sobic002G060450 Sobic002G060450 Sobic003G185250--Sobic002G060450 Sobic006G210200 Sobic006G210200 Sobic003G185250--Sobic006G210200 Sobic001G454301 Sobic001G454301 Sobic003G185250--Sobic001G454301 Sobic003G163100 Sobic003G163100 Sobic003G185250--Sobic003G163100 Sobic006G006500 Sobic006G006500 Sobic003G185250--Sobic006G006500 Sobic003G023400 Sobic003G023400 Sobic003G185250--Sobic003G023400 Sobic005G110523 Sobic005G110523 Sobic003G185250--Sobic005G110523 Sobic004G193800--Sobic003G185250 Sobic004G016500 Sobic004G016500 Sobic004G193800--Sobic004G016500 Sobic003G424100 Sobic003G424100 Sobic004G193800--Sobic003G424100 Sobic008G068800 Sobic008G068800 Sobic004G193800--Sobic008G068800 Sobic007G099500 Sobic007G099500 Sobic004G193800--Sobic007G099500 Sobic004G193800--Sobic003G023400 Sobic004G240900 Sobic004G240900 Sobic004G193800--Sobic004G240900 Sobic010G208500 Sobic010G208500 Sobic004G193800--Sobic010G208500 Sobic004G169501 Sobic004G169501 Sobic004G193800--Sobic004G169501 Sobic002G157200 Sobic002G157200 Sobic001G045700--Sobic002G157200 Sobic007G224900 Sobic007G224900 Sobic001G045700--Sobic007G224900 Sobic001G045700--Sobic003G185250 Sobic001G045700--Sobic006G006500 Sobic002G049000 Sobic002G049000 Sobic001G045700--Sobic002G049000 Sobic001G045700--Sobic002G060450 Sobic002G050500 Sobic002G050500 Sobic001G045700--Sobic002G050500 Sobic002G297800 Sobic002G297800 Sobic001G045700--Sobic002G297800 Sobic001G045700--Sobic010G208500 Sobic002G060450--Sobic003G185250 Sobic002G060450--Sobic002G049000 Sobic007G046900 Sobic007G046900 Sobic002G060450--Sobic007G046900 Sobic002G060450--Sobic006G210200 Sobic002G060450--Sobic006G006500 Sobic002G060450--Sobic001G045700 Sobic002G060450--Sobic002G050500 Sobic006G022500 Sobic006G022500 Sobic002G060450--Sobic006G022500 Sobic003G346000 Sobic003G346000 Sobic002G060450--Sobic003G346000 Sobic006G210200--Sobic002G050500 Sobic006G210200--Sobic001G454301 Sobic002G151600 Sobic002G151600 Sobic006G210200--Sobic002G151600 Sobic006G210200--Sobic003G023400 Sobic006G210200--Sobic002G157200 Sobic006G210200--Sobic003G185250 Sobic006G210200--Sobic002G060450 Sobic001G303675 Sobic001G303675 Sobic006G210200--Sobic001G303675 Sobic009G239351 Sobic009G239351 Sobic006G210200--Sobic009G239351 Sobic007G116400 Sobic007G116400 Sobic001G454301--Sobic007G116400 Sobic002G421700 Sobic002G421700 Sobic001G454301--Sobic002G421700 Sobic008G117200 Sobic008G117200 Sobic001G454301--Sobic008G117200 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic001G454301--Sobic001G094000 Sobic009G104300 Sobic009G104300 Sobic001G454301--Sobic009G104300 Sobic001G454301--Sobic009G239351 Sobic001G454301--Sobic001G303675 Sobic002G140800 Sobic002G140800 Sobic001G454301--Sobic002G140800 Sobic006G217200 Sobic006G217200 Sobic001G454301--Sobic006G217200 Sobic006G210100 Sobic006G210100 Sobic003G163100--Sobic006G210100 Sobic001G360900 Sobic001G360900 Sobic003G163100--Sobic001G360900 Sobic001G253200 Sobic001G253200 Sobic003G163100--Sobic001G253200 Sobic003G163100--Sobic001G303675 Sobic009G251300 Sobic009G251300 Sobic003G163100--Sobic009G251300 Sobic006G191400 Sobic006G191400 Sobic003G163100--Sobic006G191400 Sobic003G163100--Sobic002G151600 Sobic003G163100--Sobic003G185250 Sobic009G045700 Sobic009G045700 Sobic003G163100--Sobic009G045700 Sobic006G006500--Sobic001G045700 Sobic006G006500--Sobic002G060450 Sobic006G006500--Sobic003G185250 Sobic001G261521 Sobic001G261521 Sobic006G006500--Sobic001G261521 Sobic006G006500--Sobic001G303675 Sobic006G006500--Sobic002G049000 Sobic007G079200 Sobic007G079200 Sobic006G006500--Sobic007G079200 Sobic006G006500--Sobic001G454301 Sobic002G061400 Sobic002G061400 Sobic006G006500--Sobic002G061400 Sobic003G023400--Sobic004G193800 Sobic003G023400--Sobic002G049000 Sobic003G023400--Sobic006G210200 Sobic003G023400--Sobic003G185250 Sobic002G090400 Sobic002G090400 Sobic003G023400--Sobic002G090400 Sobic003G023400--Sobic008G068800 Sobic001G367100 Sobic001G367100 Sobic003G023400--Sobic001G367100 Sobic003G023400--Sobic001G094000 Sobic003G023400--Sobic003G163100 Sobic009G004700 Sobic009G004700 Sobic005G110523--Sobic009G004700 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic005G110523--Sobic006G009400 Sobic005G005000 Sobic005G005000 Sobic005G110523--Sobic005G005000 Sobic001G477800 Sobic001G477800 Sobic005G110523--Sobic001G477800 Sobic001G464200 Sobic001G464200 Sobic005G110523--Sobic001G464200 Sobic007G059300 Sobic007G059300 Sobic005G110523--Sobic007G059300 Sobic005G110523--Sobic004G169501 Sobic003G089650 Sobic003G089650 Sobic005G110523--Sobic003G089650 Sobic009G113600 Sobic009G113600 Sobic005G110523--Sobic009G113600
Octagon: transcription factors


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