Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G097601.3,Sobic.002G097601.2,Sobic.002G097601.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W349 , A0A1W0W324 , A0A1W0W374
Pfam PF02902
Panther DB PTHR12606 PTHR12606:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008234; cysteine-type peptidase activity GO:0006508proteolysis


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G15880 : Cysteine proteinases superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g16730.1 : ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G069100 - -
2 Sobic.007G041200 cytochrome P450, putative, expressed -
3 Sobic.001G261700 "domain confirmed by Pfam database, expression induced by IAA and BR treatments"(PubMedID : 20499123)@DUF260 domain containing protein, putative, expressed -
4 Sobic.004G322550 - -
5 Sobic.005G176875 - -
6 Sobic.010G084800 - -
7 Sobic.010G047300 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
8 Sobic.009G169050 - -
9 Sobic.008G116100 bifunctional 3-dehydroquinate dehydratase/shikimate dehydrogenase,chloroplast precursor, putative, expressed K13832: aroDE, 3-dehydroquinate dehydratase / shikimate dehydrogenase
10 Sobic.009G033500 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
11 Sobic.003G232332 - -
12 Sobic.001G284700 - -
13 Sobic.008G109600 oxidoreductase, 2OG-Fe oxygenase family protein, putative, expressed -
14 Sobic.009G244800 cell division control protein 2 homolog 3, putative, expressed K08818: cell division cycle 2-like
15 Sobic.002G015500 OsFBD13 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
16 Sobic.002G300800 - -
17 Sobic.005G176800 expressed protein -
18 Sobic.005G033400 heavy-metal-associated domain-containing protein, putative, expressed -
19 Sobic.004G071100 - -
20 Sobic.005G033600 heavy-metal-associated domain-containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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