Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G099500.1,Sobic.007G099500.2
Synonym
Functional annotation hypothetical protein
UniProt A0A1B6PGU5
Pfam PF06839
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008270; zinc ion binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g14350.1 : transposon protein, putative, CACTA, En/Spm sub-class
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G059600 KIP1, putative, expressed -
2 Sobic.004G164600 - -
3 Sobic.002G090400 polygalacturonase, putative, expressed -
4 Sobic.007G073400 SHR5-receptor-like kinase, putative, expressed -
5 Sobic.003G424100 sulfotransferase domain containing protein, expressed -
6 Sobic.004G240900 "domain confirmed by Pfam database, expression supported by NCBI EST database, expressed in leaf, flower and stem, expression induced by IAA and BR treatments"(PubMedID : 20528920)@auxin efflux carrier component, putative, expressed K13947: auxin efflux carrier family protein
7 Sobic.008G031350 - -
8 Sobic.004G212800 - -
9 Sobic.002G221700 microtubule associated protein, putative, expressed K16732: protein regulator of cytokinesis 1
10 Sobic.008G009500 pentatricopeptide, putative, expressed -
11 Sobic.004G016500 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.001G046600 cycloartenol-C-24-methyltransferase 1, putative, expressed -
13 Sobic.003G089650 - -
14 Sobic.010G208500 - -
15 Sobic.009G113600 - -
16 Sobic.002G062300 expressed protein -
17 Sobic.004G193800 hydrolase, alpha/beta fold family domain containing protein, expressed K14759: isochorismate synthase / 2-succinyl-5-enolpyruvyl-6-hydroxy-3-cyclohexene-1-carboxylate synthase / 2-succinyl-6-hydroxy-2,4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase / O-succinylbenzoate synthase
18 Sobic.006G132200 CHIT3 - Chitinase family protein precursor, expressed K01183: chitinase
19 Sobic.008G068800 cytokinin inducible protein, putative, expressed -
20 Sobic.004G076732 - K14800: pre-rRNA-processing protein TSR2


Gene co-expression network
sample Sobic007G099500 Sobic007G099500 Sobic009G059600 Sobic009G059600 Sobic007G099500--Sobic009G059600 Sobic004G164600 Sobic004G164600 Sobic007G099500--Sobic004G164600 Sobic002G090400 Sobic002G090400 Sobic007G099500--Sobic002G090400 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic007G099500--Sobic007G073400 Sobic003G424100 Sobic003G424100 Sobic007G099500--Sobic003G424100 Sobic004G240900 Sobic004G240900 Sobic007G099500--Sobic004G240900 Sobic008G031350 Sobic008G031350 Sobic007G099500--Sobic008G031350 Sobic004G212800 Sobic004G212800 Sobic007G099500--Sobic004G212800 Sobic002G221700 Sobic002G221700 Sobic007G099500--Sobic002G221700 Sobic009G059600--Sobic004G164600 Sobic009G059600--Sobic007G099500 Sobic009G059600--Sobic004G212800 Sobic009G059600--Sobic007G073400 Sobic008G068800 Sobic008G068800 Sobic009G059600--Sobic008G068800 Sobic003G128600 Sobic003G128600 Sobic009G059600--Sobic003G128600 Sobic009G059600--Sobic003G424100 Sobic007G142050 Sobic007G142050 Sobic009G059600--Sobic007G142050 Sobic004G076732 Sobic004G076732 Sobic009G059600--Sobic004G076732 Sobic004G164600--Sobic004G212800 Sobic005G110430 Sobic005G110430 Sobic004G164600--Sobic005G110430 Sobic004G164600--Sobic007G073400 Sobic008G042250 Sobic008G042250 Sobic004G164600--Sobic008G042250 Sobic008G157950 Sobic008G157950 Sobic004G164600--Sobic008G157950 Sobic001G345333 Sobic001G345333 Sobic004G164600--Sobic001G345333 Sobic002G007250 Sobic002G007250 Sobic004G164600--Sobic002G007250 SobicK009900 SobicK009900 Sobic004G164600--SobicK009900 Sobic004G164600--Sobic004G076732 Sobic002G090400--Sobic007G099500 Sobic002G049000 Sobic002G049000 Sobic002G090400--Sobic002G049000 Sobic002G090400--Sobic008G068800 Sobic004G169501 Sobic004G169501 Sobic002G090400--Sobic004G169501 Sobic004G143700 Sobic004G143700 Sobic002G090400--Sobic004G143700 Sobic002G090400--Sobic009G059600 Sobic002G090400--Sobic003G424100 Sobic002G090400--Sobic007G073400 Sobic006G145000 Sobic006G145000 Sobic002G090400--Sobic006G145000 Sobic007G073400--Sobic004G212800 Sobic007G073400--Sobic004G164600 Sobic007G073400--Sobic004G076732 Sobic008G009500 Sobic008G009500 Sobic007G073400--Sobic008G009500 Sobic009G113600 Sobic009G113600 Sobic007G073400--Sobic009G113600 Sobic007G073400--Sobic008G031350 Sobic007G073400--Sobic008G042250 Sobic007G073400--Sobic005G110430 Sobic007G073400--Sobic004G143700 Sobic003G424100--Sobic004G164600 Sobic001G046600 Sobic001G046600 Sobic003G424100--Sobic001G046600 Sobic003G424100--Sobic004G212800 Sobic003G424100--Sobic004G240900 Sobic003G424100--Sobic007G073400 Sobic003G424100--Sobic009G059600 Sobic003G424100--Sobic007G099500 Sobic004G016500 Sobic004G016500 Sobic003G424100--Sobic004G016500 Sobic003G424100--Sobic008G068800 Sobic004G240900--Sobic003G424100 Sobic006G133600 Sobic006G133600 Sobic004G240900--Sobic006G133600 Sobic004G240900--Sobic001G046600 Sobic004G240900--Sobic007G099500 Sobic004G240900--Sobic004G016500 Sobic004G240900--Sobic009G059600 Sobic003G029300 Sobic003G029300 Sobic004G240900--Sobic003G029300 Sobic004G193800 Sobic004G193800 Sobic004G240900--Sobic004G193800 Sobic004G240900--Sobic004G164600 Sobic008G031350--Sobic009G113600 Sobic008G031350--Sobic008G009500 SobicK024000 SobicK024000 Sobic008G031350--SobicK024000 Sobic008G031350--Sobic007G073400 Sobic002G062300 Sobic002G062300 Sobic008G031350--Sobic002G062300 Sobic008G031350--Sobic004G164600 Sobic008G031350--Sobic002G007250 Sobic005G212600 Sobic005G212600 Sobic008G031350--Sobic005G212600 Sobic006G132200 Sobic006G132200 Sobic008G031350--Sobic006G132200 Sobic004G212800--Sobic007G073400 Sobic004G212800--Sobic004G164600 Sobic001G024200 Sobic001G024200 Sobic004G212800--Sobic001G024200 Sobic004G212800--Sobic001G345333 Sobic004G212800--Sobic002G007250 Sobic010G248200 Sobic010G248200 Sobic004G212800--Sobic010G248200 Sobic004G212800--Sobic004G076732 Sobic008G161401 Sobic008G161401 Sobic004G212800--Sobic008G161401 Sobic004G112500 Sobic004G112500 Sobic004G212800--Sobic004G112500 Sobic002G221700--Sobic004G164600 Sobic002G221700--Sobic008G042250 Sobic001G253100 Sobic001G253100 Sobic002G221700--Sobic001G253100 Sobic002G221700--Sobic005G110430 Sobic002G221700--Sobic004G076732 Sobic002G221700--Sobic008G009500 Sobic002G221700--Sobic007G073400 Sobic002G221700--Sobic008G157950 Sobic002G221700--Sobic004G212800
Octagon: transcription factors


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