Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G318350.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W001
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G154200 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
2 Sobic.003G126700 NB-ARC domain containing protein, expressed -
3 Sobic.006G223700 ABC transporter, ATP-binding protein, putative, expressed -
4 Sobic.003G064000 expressed protein -
5 Sobic.002G269800 - -
6 Sobic.003G372950 - -
7 Sobic.004G286450 - -
8 Sobic.006G167850 - -
9 Sobic.007G193000 expressed protein -
10 Sobic.009G156700 protein transport protein, putative, expressed -
11 Sobic.009G197350 - -
12 Sobic.002G124766 - -
13 Sobic.007G145300 zinc knuckle family protein, expressed -
14 Sobic.007G154001 - -
15 Sobic.001G443850 - -
16 Sobic.005G229232 - -
17 Sobic.010G133800 - -
18 Sobic.005G057600 expressed protein -
19 Sobic.007G003300 - -
20 Sobic.010G131101 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G318350 Sobic003G318350 Sobic008G154200 Sobic008G154200 Sobic003G318350--Sobic008G154200 Sobic003G126700 Sobic003G126700 Sobic003G318350--Sobic003G126700 Sobic006G223700 Sobic006G223700 Sobic003G318350--Sobic006G223700 Sobic003G064000 Sobic003G064000 Sobic003G318350--Sobic003G064000 Sobic002G269800 Sobic002G269800 Sobic003G318350--Sobic002G269800 Sobic003G372950 Sobic003G372950 Sobic003G318350--Sobic003G372950 Sobic004G286450 Sobic004G286450 Sobic003G318350--Sobic004G286450 Sobic006G167850 Sobic006G167850 Sobic003G318350--Sobic006G167850 Sobic007G193000 Sobic007G193000 Sobic003G318350--Sobic007G193000 Sobic008G154200--Sobic003G064000 Sobic008G154200--Sobic003G372950 Sobic008G154200--Sobic004G286450 Sobic008G154200--Sobic006G223700 Sobic008G154200--Sobic006G167850 Sobic008G154200--Sobic003G126700 Sobic005G057600 Sobic005G057600 Sobic008G154200--Sobic005G057600 Sobic001G443850 Sobic001G443850 Sobic008G154200--Sobic001G443850 Sobic008G154200--Sobic002G269800 Sobic003G126700--Sobic002G269800 Sobic003G126700--Sobic006G223700 Sobic009G156700 Sobic009G156700 Sobic003G126700--Sobic009G156700 Sobic009G197350 Sobic009G197350 Sobic003G126700--Sobic009G197350 Sobic007G145300 Sobic007G145300 Sobic003G126700--Sobic007G145300 Sobic003G126700--Sobic008G154200 Sobic002G124766 Sobic002G124766 Sobic003G126700--Sobic002G124766 Sobic003G126700--Sobic007G193000 Sobic007G003300 Sobic007G003300 Sobic003G126700--Sobic007G003300 Sobic006G223700--Sobic003G126700 Sobic006G223700--Sobic002G269800 Sobic006G223700--Sobic008G154200 Sobic006G223700--Sobic009G156700 Sobic006G223700--Sobic009G197350 Sobic006G223700--Sobic003G064000 Sobic006G223700--Sobic007G145300 Sobic006G223700--Sobic007G193000 Sobic006G223700--Sobic002G124766 Sobic003G064000--Sobic003G372950 Sobic003G064000--Sobic008G154200 Sobic003G064000--Sobic004G286450 Sobic003G064000--Sobic005G057600 Sobic003G064000--Sobic006G167850 Sobic003G064000--Sobic006G223700 Sobic003G064000--Sobic001G443850 Sobic005G229232 Sobic005G229232 Sobic003G064000--Sobic005G229232 Sobic003G064000--Sobic003G126700 Sobic002G269800--Sobic003G126700 Sobic002G269800--Sobic009G156700 Sobic002G269800--Sobic009G197350 Sobic002G269800--Sobic007G145300 Sobic002G269800--Sobic006G223700 Sobic002G269800--Sobic002G124766 Sobic002G269800--Sobic007G193000 Sobic002G269800--Sobic007G003300 Sobic002G269800--Sobic008G154200 Sobic003G372950--Sobic003G064000 Sobic003G372950--Sobic008G154200 Sobic003G372950--Sobic004G286450 Sobic003G372950--Sobic005G057600 Sobic003G372950--Sobic006G167850 Sobic001G062200 Sobic001G062200 Sobic003G372950--Sobic001G062200 Sobic003G372950--Sobic001G443850 Sobic003G372950--Sobic006G223700 Sobic007G154001 Sobic007G154001 Sobic003G372950--Sobic007G154001 Sobic004G286450--Sobic003G372950 Sobic004G286450--Sobic003G064000 Sobic004G286450--Sobic008G154200 Sobic004G286450--Sobic005G057600 Sobic004G286450--Sobic006G167850 Sobic004G286450--Sobic001G062200 Sobic004G286450--Sobic001G443850 Sobic004G286450--Sobic006G223700 Sobic004G286450--Sobic007G154001 Sobic006G167850--Sobic008G154200 Sobic006G167850--Sobic003G064000 Sobic006G167850--Sobic003G372950 Sobic006G167850--Sobic004G286450 Sobic006G167850--Sobic006G223700 Sobic006G167850--Sobic005G057600 Sobic006G167850--Sobic003G126700 Sobic006G167850--Sobic001G062200 Sobic006G167850--Sobic001G443850 Sobic007G193000--Sobic003G126700 Sobic007G193000--Sobic002G269800 Sobic007G193000--Sobic006G223700 Sobic007G193000--Sobic009G156700 Sobic007G193000--Sobic009G197350 Sobic007G193000--Sobic008G154200 Sobic007G193000--Sobic007G145300 Sobic007G193000--Sobic002G124766 Sobic007G193000--Sobic003G064000
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.