Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G255600.1
Synonym Sb03g031050
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XGN6
Pfam -
Panther DB PTHR21229 PTHR21229:SF24
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016021; integral component of membrane


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G52155 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g48570.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a028062
Brachypodium KQK09176 , KQK09177
Barley HORVU3Hr1G062350.5 , HORVU3Hr1G062350.4 , HORVU3Hr1G062350.7 , HORVU3Hr1G062350.6 , HORVU3Hr1G062350.1 , HORVU3Hr1G062350.3 , HORVU3Hr1G062350.2
Wheat TraesCS3A02G269400 , TraesCS3D02G269100 , TraesCS3B02G303400
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G106500 PMR5, putative, expressed -
2 Sobic.001G342000 expressed protein -
3 Sobic.001G293100 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
4 Sobic.005G182900 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
5 Sobic.006G097900 xyloglucan fucosyltransferase, putative, expressed K13681: xyloglucan fucosyltransferase
6 Sobic.004G014600 disease resistance protein RGA2, putative, expressed -
7 Sobic.006G171100 expansin precursor, putative, expressed -
8 Sobic.002G029500 cytochrome P450 84A1, putative, expressed K09755: CYP84A, ferulate-5-hydroxylase
9 Sobic.008G033100 protein kinase domain containing protein, expressed K17302: COPB2, coatomer subunit beta'
10 Sobic.005G106300 expressed protein -
11 Sobic.003G161400 powdery mildew resistance protein PM3A, putative, expressed -
12 Sobic.007G015000 methyltransferase domain containing protein, expressed -
13 Sobic.003G441601 - -
14 Sobic.002G289500 carbohydrate binding protein, putative, expressed -
15 Sobic.010G152500 glycosyltransferase, putative, expressed -
16 Sobic.001G415100 terpene synthase, putative, expressed -
17 Sobic.005G216600 plant protein of unknown function domain containing protein, expressed -
18 Sobic.007G064900 metal cation transporter, putative, expressed K14709: SLC39A1_2_3, solute carrier family 39 (zinc transporter), member 1/2/3
19 Sobic.010G213600 histidine kinase, putative, expressed -
20 Sobic.009G095800 DUF623 domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G255600 Sobic003G255600 Sobic009G106500 Sobic009G106500 Sobic003G255600--Sobic009G106500 Sobic001G342000 Sobic001G342000 Sobic003G255600--Sobic001G342000 Sobic001G293100 Sobic001G293100 Sobic003G255600--Sobic001G293100 Sobic005G182900 Sobic005G182900 Sobic003G255600--Sobic005G182900 Sobic006G097900 Sobic006G097900 Sobic003G255600--Sobic006G097900 Sobic004G014600 Sobic004G014600 Sobic003G255600--Sobic004G014600 Sobic006G171100 Sobic006G171100 Sobic003G255600--Sobic006G171100 Sobic002G029500 Sobic002G029500 Sobic003G255600--Sobic002G029500 Sobic008G033100 Sobic008G033100 Sobic003G255600--Sobic008G033100 Sobic002G289500 Sobic002G289500 Sobic009G106500--Sobic002G289500 Sobic009G106500--Sobic003G255600 Sobic006G047200 Sobic006G047200 Sobic009G106500--Sobic006G047200 Sobic008G058600 Sobic008G058600 Sobic009G106500--Sobic008G058600 Sobic002G082000 Sobic002G082000 Sobic009G106500--Sobic002G082000 Sobic006G230100 Sobic006G230100 Sobic009G106500--Sobic006G230100 Sobic009G106500--Sobic006G171100 Sobic001G153100 Sobic001G153100 Sobic009G106500--Sobic001G153100 Sobic009G106500--Sobic002G029500 Sobic001G342000--Sobic004G014600 Sobic010G213600 Sobic010G213600 Sobic001G342000--Sobic010G213600 Sobic001G342000--Sobic008G033100 Sobic002G166150 Sobic002G166150 Sobic001G342000--Sobic002G166150 Sobic001G342000--Sobic002G029500 Sobic009G165100 Sobic009G165100 Sobic001G342000--Sobic009G165100 Sobic003G079100 Sobic003G079100 Sobic001G342000--Sobic003G079100 Sobic001G272800 Sobic001G272800 Sobic001G342000--Sobic001G272800 Sobic001G342000--Sobic003G255600 Sobic007G015000 Sobic007G015000 Sobic001G293100--Sobic007G015000 Sobic005G097900 Sobic005G097900 Sobic001G293100--Sobic005G097900 Sobic001G293100--Sobic008G033100 Sobic010G242800 Sobic010G242800 Sobic001G293100--Sobic010G242800 Sobic003G161400 Sobic003G161400 Sobic001G293100--Sobic003G161400 Sobic001G293100--Sobic005G182900 Sobic001G415100 Sobic001G415100 Sobic001G293100--Sobic001G415100 Sobic001G293100--Sobic002G029500 Sobic001G293100--Sobic006G230100 Sobic005G182900--Sobic008G033100 Sobic002G019000 Sobic002G019000 Sobic005G182900--Sobic002G019000 Sobic005G182900--Sobic010G242800 Sobic005G182900--Sobic002G029500 Sobic005G182900--Sobic001G415100 Sobic005G065700 Sobic005G065700 Sobic005G182900--Sobic005G065700 Sobic005G182800 Sobic005G182800 Sobic005G182900--Sobic005G182800 Sobic005G182900--Sobic003G161400 Sobic005G182900--Sobic001G293100 Sobic004G121600 Sobic004G121600 Sobic006G097900--Sobic004G121600 Sobic010G268700 Sobic010G268700 Sobic006G097900--Sobic010G268700 Sobic003G441700 Sobic003G441700 Sobic006G097900--Sobic003G441700 Sobic001G181600 Sobic001G181600 Sobic006G097900--Sobic001G181600 Sobic001G218400 Sobic001G218400 Sobic006G097900--Sobic001G218400 Sobic005G216600 Sobic005G216600 Sobic006G097900--Sobic005G216600 Sobic006G097900--Sobic001G293100 Sobic003G441800 Sobic003G441800 Sobic006G097900--Sobic003G441800 Sobic005G119900 Sobic005G119900 Sobic006G097900--Sobic005G119900 Sobic003G441601 Sobic003G441601 Sobic004G014600--Sobic003G441601 Sobic007G090600 Sobic007G090600 Sobic004G014600--Sobic007G090600 Sobic004G014600--Sobic009G165100 Sobic004G014600--Sobic005G182800 Sobic004G014600--Sobic003G079100 Sobic004G014600--Sobic010G213600 Sobic004G014600--Sobic005G182900 Sobic006G031100 Sobic006G031100 Sobic004G014600--Sobic006G031100 Sobic004G014600--Sobic002G289500 Sobic009G136800 Sobic009G136800 Sobic006G171100--Sobic009G136800 Sobic002G391300 Sobic002G391300 Sobic006G171100--Sobic002G391300 Sobic010G010000 Sobic010G010000 Sobic006G171100--Sobic010G010000 Sobic006G171100--Sobic003G441601 Sobic002G111900 Sobic002G111900 Sobic006G171100--Sobic002G111900 Sobic005G046400 Sobic005G046400 Sobic006G171100--Sobic005G046400 Sobic006G171100--Sobic002G289500 Sobic005G226400 Sobic005G226400 Sobic006G171100--Sobic005G226400 Sobic006G171100--Sobic006G047200 Sobic002G029500--Sobic005G182900 Sobic007G064900 Sobic007G064900 Sobic002G029500--Sobic007G064900 Sobic002G029500--Sobic005G097900 Sobic005G106300 Sobic005G106300 Sobic002G029500--Sobic005G106300 Sobic002G029500--Sobic008G033100 Sobic002G029500--Sobic002G289500 Sobic002G029500--Sobic001G415100 Sobic002G029500--Sobic007G015000 Sobic002G029500--Sobic002G082000 Sobic008G033100--Sobic010G242800 Sobic008G033100--Sobic005G182900 Sobic008G033100--Sobic001G293100 Sobic008G033100--Sobic003G161400 Sobic008G033100--Sobic005G097900 Sobic008G033100--Sobic002G019000 Sobic008G033100--Sobic010G213600 Sobic008G033100--Sobic002G029500 Sobic008G033100--Sobic001G415100
Octagon: transcription factors


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