Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G182200.1
Synonym Sb03g024020
Functional annotation 1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase homolog 1, putative, expressed
UniProt C5XMV9
Pfam PF14226 PF03171
Panther DB PTHR10209 PTHR10209:SF191
NCBI CDD KOG0143; Iron/ascorbate family oxidoreductases
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016491; oxidoreductase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G06620 : 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g35230.1 : 1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase homolog 1, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley HORVU7Hr1G045660.3 , HORVU7Hr1G045690.4 , HORVU7Hr1G045690.3
Wheat TraesCS7A02G222900 , TraesCS7D02G224500
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G100700 anthocyanidin 5,3-O-glucosyltransferase, putative, expressed -
2 Sobic.006G019700 transferase family protein, putative, expressed -
3 Sobic.003G426500 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
4 Sobic.006G092700 MLO domain containing protein, putative, expressed K08472: mlo protein
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7 Sobic.004G322100 hypro1, putative, expressed -
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9 Sobic.007G008600 GLTP domain containing protein, putative, expressed -
10 Sobic.006G135300 expressed protein -
11 Sobic.003G064800 dirigent, putative, expressed -
12 Sobic.004G029100 periplasmic beta-glucosidase precursor, putative, expressed K05349: beta-glucosidase
13 Sobic.010G028100 GDP-mannose 4,6 dehydratase 2, putative, expressed K01711: gmd, GDPmannose 4,6-dehydratase
14 Sobic.002G255000 AIR12, putative, expressed -
15 Sobic.002G068000 expressed protein -
16 Sobic.006G028500 1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase homolog 2, putative, expressed -
17 Sobic.010G082000 xyloglucan fucosyltransferase, putative, expressed K13681: xyloglucan fucosyltransferase
18 Sobic.003G349400 expressed protein -
19 Sobic.004G271800 WRKY66, expressed -
20 Sobic.010G152400 glycosyltransferase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G182200 Sobic003G182200 Sobic007G100700 Sobic007G100700 Sobic003G182200--Sobic007G100700 Sobic006G019700 Sobic006G019700 Sobic003G182200--Sobic006G019700 Sobic003G426500 Sobic003G426500 Sobic003G182200--Sobic003G426500 Sobic006G092700 Sobic006G092700 Sobic003G182200--Sobic006G092700 Sobic008G011700 Sobic008G011700 Sobic003G182200--Sobic008G011700 Sobic004G306900 Sobic004G306900 Sobic003G182200--Sobic004G306900 Sobic004G322100 Sobic004G322100 Sobic003G182200--Sobic004G322100 Sobic009G259800 Sobic009G259800 Sobic003G182200--Sobic009G259800 Sobic007G008600 Sobic007G008600 Sobic003G182200--Sobic007G008600 Sobic007G100700--Sobic003G182200 Sobic007G100700--Sobic003G426500 Sobic007G100700--Sobic007G008600 Sobic002G255000 Sobic002G255000 Sobic007G100700--Sobic002G255000 Sobic007G100700--Sobic008G011700 Sobic010G066800 Sobic010G066800 Sobic007G100700--Sobic010G066800 Sobic006G106900 Sobic006G106900 Sobic007G100700--Sobic006G106900 Sobic003G064800 Sobic003G064800 Sobic007G100700--Sobic003G064800 Sobic007G100700--Sobic004G306900 Sobic006G019700--Sobic004G306900 Sobic006G019700--Sobic003G182200 Sobic006G028500 Sobic006G028500 Sobic006G019700--Sobic006G028500 Sobic006G019700--Sobic004G322100 Sobic010G082000 Sobic010G082000 Sobic006G019700--Sobic010G082000 Sobic006G019700--Sobic006G092700 Sobic010G152400 Sobic010G152400 Sobic006G019700--Sobic010G152400 Sobic006G135300 Sobic006G135300 Sobic006G019700--Sobic006G135300 Sobic003G000100 Sobic003G000100 Sobic006G019700--Sobic003G000100 Sobic003G426500--Sobic007G100700 Sobic003G426500--Sobic003G182200 Sobic003G426500--Sobic008G011700 Sobic003G426500--Sobic010G066800 Sobic001G067100 Sobic001G067100 Sobic003G426500--Sobic001G067100 Sobic002G068000 Sobic002G068000 Sobic003G426500--Sobic002G068000 Sobic003G426500--Sobic009G259800 Sobic010G158400 Sobic010G158400 Sobic003G426500--Sobic010G158400 Sobic003G349400 Sobic003G349400 Sobic003G426500--Sobic003G349400 Sobic006G092700--Sobic006G135300 Sobic006G092700--Sobic010G082000 Sobic010G028100 Sobic010G028100 Sobic006G092700--Sobic010G028100 Sobic006G092700--Sobic003G000100 Sobic007G073000 Sobic007G073000 Sobic006G092700--Sobic007G073000 Sobic006G092700--Sobic010G152400 Sobic002G146000 Sobic002G146000 Sobic006G092700--Sobic002G146000 Sobic006G092700--Sobic004G306900 Sobic006G092700--Sobic006G019700 Sobic008G011700--Sobic007G100700 Sobic008G011700--Sobic003G426500 Sobic008G011700--Sobic001G067100 Sobic008G011700--Sobic003G182200 Sobic008G011700--Sobic010G066800 Sobic008G011700--Sobic002G255000 Sobic008G011700--Sobic003G349400 Sobic003G140700 Sobic003G140700 Sobic008G011700--Sobic003G140700 Sobic008G011700--Sobic004G306900 Sobic004G306900--Sobic006G028500 Sobic004G306900--Sobic003G064800 Sobic007G086300 Sobic007G086300 Sobic004G306900--Sobic007G086300 Sobic004G306900--Sobic003G000100 Sobic004G106100 Sobic004G106100 Sobic004G306900--Sobic004G106100 Sobic004G306900--Sobic006G019700 Sobic003G319400 Sobic003G319400 Sobic004G306900--Sobic003G319400 Sobic004G306900--Sobic010G152400 Sobic004G306900--Sobic004G322100 Sobic004G322100--Sobic003G000100 Sobic004G322100--Sobic010G152400 Sobic004G322100--Sobic003G140700 Sobic004G323300 Sobic004G323300 Sobic004G322100--Sobic004G323300 Sobic004G322100--Sobic004G306900 Sobic004G322100--Sobic006G019700 Sobic004G029100 Sobic004G029100 Sobic004G322100--Sobic004G029100 Sobic004G322100--Sobic006G028500 Sobic004G110700 Sobic004G110700 Sobic004G322100--Sobic004G110700 Sobic005G080600 Sobic005G080600 Sobic009G259800--Sobic005G080600 Sobic003G185300 Sobic003G185300 Sobic009G259800--Sobic003G185300 Sobic007G206800 Sobic007G206800 Sobic009G259800--Sobic007G206800 Sobic009G259800--Sobic006G019700 Sobic009G259800--Sobic007G100700 Sobic006G196400 Sobic006G196400 Sobic009G259800--Sobic006G196400 Sobic009G259800--Sobic002G068000 Sobic010G234500 Sobic010G234500 Sobic009G259800--Sobic010G234500 Sobic009G259800--Sobic003G426500 Sobic007G008600--Sobic002G255000 Sobic007G008600--Sobic007G100700 Sobic007G008600--Sobic003G064800 Sobic006G273300 Sobic006G273300 Sobic007G008600--Sobic006G273300 Sobic007G008600--Sobic006G106900 Sobic005G127400 Sobic005G127400 Sobic007G008600--Sobic005G127400 Sobic007G008600--Sobic004G029100 Sobic007G008600--Sobic003G182200 Sobic006G225500 Sobic006G225500 Sobic007G008600--Sobic006G225500
Octagon: transcription factors


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