Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G317800.1
Synonym
Functional annotation BNR/Asp-box repeat family protein, putative, expressed
UniProt A0A1W0W6J4
Pfam PF13088
Panther DB PTHR33307 PTHR33307:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G57700 : BNR/Asp-box repeat family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g33220.1 : BNR/Asp-box repeat family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a014776
Brachypodium PNT75017
Barley HORVU2Hr1G046590.23 , HORVU2Hr1G046590.22 , HORVU2Hr1G046590.21 , HORVU2Hr1G046590.20 , HORVU2Hr1G046590.24 , HORVU2Hr1G046590.12 , HORVU2Hr1G046590.13 , HORVU2Hr1G046590.10 , HORVU2Hr1G046590.11 , HORVU2Hr1G046590.16 , HORVU2Hr1G046590.17 , HORVU2Hr1G046590.14 , HORVU2Hr1G046590.15 , HORVU2Hr1G046590.18 , HORVU2Hr1G046590.19 , HORVU2Hr1G046590.8 , HORVU2Hr1G046590.9 , HORVU2Hr1G046590.1 , HORVU2Hr1G046590.2 , HORVU2Hr1G046590.3 , HORVU2Hr1G046590.4 , HORVU2Hr1G046590.5 , HORVU2Hr1G046590.6 , HORVU2Hr1G046590.7
Wheat TraesCS2A02G222800 , TraesCS2A02G222800 , TraesCS2A02G222800 , TraesCS2A02G222800 , TraesCS2A02G222800 , TraesCS2B02G248400 , TraesCS2B02G248400 , TraesCS2B02G248400 , TraesCS2D02G228900 , TraesCS2D02G228900
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.002G317800


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G096000 resistance protein, putative, expressed -
2 Sobic.002G303100 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
3 Sobic.002G346600 transporter family protein, putative, expressed -
4 Sobic.001G215900 TKL_IRAK_DUF26-lf.4 - DUF26 kinases have homology to DUF26 containing loci, expressed -
5 Sobic.001G366800 alpha-N-acetylglucosaminidase, putative, expressed K01205: alpha-N-acetylglucosaminidase
6 Sobic.003G052600 - -
7 Sobic.010G122200 cadmium tolerance factor, putative, expressed -
8 Sobic.009G013700 pectinacetylesterase domain containing protein, expressed -
9 Sobic.001G069800 tubulin/FtsZ domain containing protein, putative, expressed K07375: tubulin beta
10 Sobic.004G086100 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed -
11 Sobic.010G138500 lectin protein kinase family protein, putative, expressed -
12 Sobic.007G208900 resistance protein LR10, putative, expressed -
13 Sobic.009G123500 TKL_IRAK_CR4L.5 - The CR4L subfamily has homology with Crinkly4, expressed -
14 Sobic.001G532700 WD repeat-containing protein 44, putative, expressed -
15 Sobic.004G006700 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed -
16 Sobic.009G144200 glycosyl transferase, putative, expressed -
17 Sobic.003G196900 esterase/lipase/thioesterase, putative, expressed K06889: uncharacterized protein
18 Sobic.003G151300 serine/threonine-protein kinase, putative, expressed -
19 Sobic.008G008400 F-box/LRR-repeat protein 3, putative, expressed -
20 Sobic.001G023400 chloroplast protein import component Toc159, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G317800 Sobic002G317800 Sobic005G096000 Sobic005G096000 Sobic002G317800--Sobic005G096000 Sobic002G303100 Sobic002G303100 Sobic002G317800--Sobic002G303100 Sobic002G346600 Sobic002G346600 Sobic002G317800--Sobic002G346600 Sobic001G215900 Sobic001G215900 Sobic002G317800--Sobic001G215900 Sobic001G366800 Sobic001G366800 Sobic002G317800--Sobic001G366800 Sobic003G052600 Sobic003G052600 Sobic002G317800--Sobic003G052600 Sobic010G122200 Sobic010G122200 Sobic002G317800--Sobic010G122200 Sobic009G013700 Sobic009G013700 Sobic002G317800--Sobic009G013700 Sobic001G069800 Sobic001G069800 Sobic002G317800--Sobic001G069800 Sobic005G096000--Sobic002G317800 Sobic005G212500 Sobic005G212500 Sobic005G096000--Sobic005G212500 Sobic008G136200 Sobic008G136200 Sobic005G096000--Sobic008G136200 Sobic008G091671 Sobic008G091671 Sobic005G096000--Sobic008G091671 Sobic010G015000 Sobic010G015000 Sobic005G096000--Sobic010G015000 Sobic005G096000--Sobic003G052600 Sobic001G464100 Sobic001G464100 Sobic005G096000--Sobic001G464100 Sobic010G280100 Sobic010G280100 Sobic005G096000--Sobic010G280100 Sobic005G099150 Sobic005G099150 Sobic005G096000--Sobic005G099150 Sobic002G303100--Sobic010G122200 Sobic002G303100--Sobic002G317800 Sobic002G303100--Sobic005G096000 Sobic005G154100 Sobic005G154100 Sobic002G303100--Sobic005G154100 Sobic006G098100 Sobic006G098100 Sobic002G303100--Sobic006G098100 Sobic004G104800 Sobic004G104800 Sobic002G303100--Sobic004G104800 Sobic002G303100--Sobic001G464100 Sobic006G177300 Sobic006G177300 Sobic002G303100--Sobic006G177300 Sobic005G076500 Sobic005G076500 Sobic002G303100--Sobic005G076500 Sobic006G063300 Sobic006G063300 Sobic002G346600--Sobic006G063300 Sobic007G225800 Sobic007G225800 Sobic002G346600--Sobic007G225800 Sobic003G315332 Sobic003G315332 Sobic002G346600--Sobic003G315332 Sobic002G186000 Sobic002G186000 Sobic002G346600--Sobic002G186000 Sobic002G076400 Sobic002G076400 Sobic002G346600--Sobic002G076400 Sobic002G346600--Sobic005G212500 Sobic004G016500 Sobic004G016500 Sobic002G346600--Sobic004G016500 Sobic007G142050 Sobic007G142050 Sobic002G346600--Sobic007G142050 Sobic001G046600 Sobic001G046600 Sobic002G346600--Sobic001G046600 Sobic010G242900 Sobic010G242900 Sobic001G215900--Sobic010G242900 Sobic001G215900--Sobic001G366800 Sobic002G168600 Sobic002G168600 Sobic001G215900--Sobic002G168600 Sobic010G138500 Sobic010G138500 Sobic001G215900--Sobic010G138500 Sobic004G134100 Sobic004G134100 Sobic001G215900--Sobic004G134100 Sobic004G247300 Sobic004G247300 Sobic001G215900--Sobic004G247300 Sobic006G130501 Sobic006G130501 Sobic001G215900--Sobic006G130501 Sobic001G215900--Sobic009G013700 Sobic009G133900 Sobic009G133900 Sobic001G215900--Sobic009G133900 Sobic009G055400 Sobic009G055400 Sobic001G366800--Sobic009G055400 Sobic001G366800--Sobic001G215900 Sobic002G301500 Sobic002G301500 Sobic001G366800--Sobic002G301500 Sobic001G366800--Sobic004G134100 Sobic001G366800--Sobic006G177300 Sobic001G366800--Sobic004G247300 Sobic002G393200 Sobic002G393200 Sobic001G366800--Sobic002G393200 Sobic001G366800--Sobic010G138500 Sobic001G366800--Sobic010G242900 Sobic001G532700 Sobic001G532700 Sobic003G052600--Sobic001G532700 Sobic003G052600--Sobic005G096000 Sobic009G112400 Sobic009G112400 Sobic003G052600--Sobic009G112400 Sobic004G175600 Sobic004G175600 Sobic003G052600--Sobic004G175600 Sobic008G125100 Sobic008G125100 Sobic003G052600--Sobic008G125100 Sobic002G420300 Sobic002G420300 Sobic003G052600--Sobic002G420300 Sobic003G245900 Sobic003G245900 Sobic003G052600--Sobic003G245900 Sobic003G052600--Sobic002G317800 Sobic002G192500 Sobic002G192500 Sobic003G052600--Sobic002G192500 Sobic010G122200--Sobic002G303100 Sobic010G015800 Sobic010G015800 Sobic010G122200--Sobic010G015800 Sobic010G122200--Sobic002G317800 Sobic008G064601 Sobic008G064601 Sobic010G122200--Sobic008G064601 Sobic006G201700 Sobic006G201700 Sobic010G122200--Sobic006G201700 Sobic001G131100 Sobic001G131100 Sobic010G122200--Sobic001G131100 Sobic010G122200--Sobic005G096000 Sobic005G194900 Sobic005G194900 Sobic010G122200--Sobic005G194900 Sobic008G107300 Sobic008G107300 Sobic010G122200--Sobic008G107300 Sobic009G030300 Sobic009G030300 Sobic009G013700--Sobic009G030300 Sobic008G008400 Sobic008G008400 Sobic009G013700--Sobic008G008400 Sobic006G033700 Sobic006G033700 Sobic009G013700--Sobic006G033700 Sobic009G013700--Sobic010G242900 Sobic009G013700--Sobic001G215900 Sobic001G226000 Sobic001G226000 Sobic009G013700--Sobic001G226000 Sobic003G347300 Sobic003G347300 Sobic009G013700--Sobic003G347300 Sobic009G013700--Sobic002G168600 Sobic002G218700 Sobic002G218700 Sobic009G013700--Sobic002G218700 Sobic009G026200 Sobic009G026200 Sobic001G069800--Sobic009G026200 Sobic004G086100 Sobic004G086100 Sobic001G069800--Sobic004G086100 Sobic004G067000 Sobic004G067000 Sobic001G069800--Sobic004G067000 Sobic001G069800--Sobic004G134100 Sobic001G420700 Sobic001G420700 Sobic001G069800--Sobic001G420700 Sobic004G006700 Sobic004G006700 Sobic001G069800--Sobic004G006700 Sobic003G151300 Sobic003G151300 Sobic001G069800--Sobic003G151300 Sobic001G467000 Sobic001G467000 Sobic001G069800--Sobic001G467000 Sobic008G139700 Sobic008G139700 Sobic001G069800--Sobic008G139700
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.