Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G280300.1
Synonym Sb02g031290
Functional annotation expressed protein
UniProt C5X6W2
Pfam PF05553
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g36850.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a049317
Brachypodium KQJ91249
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G170900 expressed protein -
2 Sobic.004G156900 OsGrx_C8 - glutaredoxin subgroup III, expressed K03676: grxC, GLRX, glutaredoxin 3
3 Sobic.005G047100 actin, putative, expressed K10355: actin, other eukaryote
4 Sobic.009G021700 expressed protein -
5 Sobic.004G170800 serine-aspartate repeat-containing protein I precursor, putative, expressed -
6 Sobic.001G107200 tubulin/FtsZ domain containing protein, putative, expressed K07374: tubulin alpha
7 Sobic.009G242501 - -
8 Sobic.001G528600 remorin family protein, putative, expressed -
9 Sobic.008G143000 expressed protein -
10 Sobic.005G130600 expressed protein -
11 Sobic.003G321400 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.007G225400 phosphate-induced protein 1 conserved region domain containing protein, expressed -
13 Sobic.003G003700 ABIL2, putative, expressed -
14 Sobic.006G252466 - K14488: SAUR family protein
15 Sobic.003G115200 expressed protein -
16 Sobic.010G277300 "BRD2(Ortholog in rice:Hong et al., 2005)"(PubMedID : 31659939)@FAD-linked oxidoreductase protein, putative, expressed K09828: DHCR24, Delta24-sterol reductase
17 Sobic.003G420100 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K13207: CUGBP, BRUNOL, CUG-BP- and ETR3-like factor
18 Sobic.009G088200 -(PubMedID : 26976818)@triosephosphate/phosphate translocator(PubMedID : 27016024)@phosphate/phosphate translocator, putative, expressed K15283: solute carrier family 35, member E1
19 Sobic.003G250700 fasciclin domain containing protein, expressed -
20 Sobic.006G054600 OsGrx_C8 - glutaredoxin subgroup III, expressed K03676: grxC, GLRX, glutaredoxin 3


Gene co-expression network
sample Sobic002G280300 Sobic002G280300 Sobic004G170900 Sobic004G170900 Sobic002G280300--Sobic004G170900 Sobic004G156900 Sobic004G156900 Sobic002G280300--Sobic004G156900 Sobic005G047100 Sobic005G047100 Sobic002G280300--Sobic005G047100 Sobic009G021700 Sobic009G021700 Sobic002G280300--Sobic009G021700 Sobic004G170800 Sobic004G170800 Sobic002G280300--Sobic004G170800 Sobic001G107200 Sobic001G107200 Sobic002G280300--Sobic001G107200 Sobic009G242501 Sobic009G242501 Sobic002G280300--Sobic009G242501 Sobic001G528600 Sobic001G528600 Sobic002G280300--Sobic001G528600 Sobic008G143000 Sobic008G143000 Sobic002G280300--Sobic008G143000 Sobic007G225400 Sobic007G225400 Sobic004G170900--Sobic007G225400 Sobic010G216600 Sobic010G216600 Sobic004G170900--Sobic010G216600 Sobic004G170900--Sobic005G047100 Sobic006G054600 Sobic006G054600 Sobic004G170900--Sobic006G054600 Sobic004G170900--Sobic009G242501 Sobic002G224200 Sobic002G224200 Sobic004G170900--Sobic002G224200 Sobic004G170900--Sobic002G280300 Sobic004G170900--Sobic004G156900 Sobic004G170900--Sobic009G021700 Sobic004G156900--Sobic006G054600 Sobic001G264400 Sobic001G264400 Sobic004G156900--Sobic001G264400 Sobic009G061400 Sobic009G061400 Sobic004G156900--Sobic009G061400 Sobic004G156900--Sobic008G143000 Sobic005G110600 Sobic005G110600 Sobic004G156900--Sobic005G110600 Sobic008G077300 Sobic008G077300 Sobic004G156900--Sobic008G077300 Sobic004G156900--Sobic004G170800 Sobic004G156900--Sobic004G170900 Sobic004G156900--Sobic002G280300 Sobic004G297950 Sobic004G297950 Sobic005G047100--Sobic004G297950 Sobic003G247600 Sobic003G247600 Sobic005G047100--Sobic003G247600 Sobic005G047100--Sobic007G225400 Sobic005G047100--Sobic004G170900 Sobic001G521300 Sobic001G521300 Sobic005G047100--Sobic001G521300 Sobic003G321400 Sobic003G321400 Sobic005G047100--Sobic003G321400 Sobic005G047100--Sobic004G170800 Sobic003G135400 Sobic003G135400 Sobic005G047100--Sobic003G135400 Sobic003G420100 Sobic003G420100 Sobic005G047100--Sobic003G420100 Sobic005G121700 Sobic005G121700 Sobic009G021700--Sobic005G121700 Sobic009G021700--Sobic009G242501 Sobic009G021700--Sobic007G225400 Sobic007G208100 Sobic007G208100 Sobic009G021700--Sobic007G208100 Sobic009G021700--Sobic003G420100 Sobic009G021700--Sobic008G143000 Sobic009G021700--Sobic004G170900 Sobic009G021700--Sobic002G280300 Sobic009G021700--Sobic008G077300 Sobic004G170800--Sobic001G264400 Sobic001G245800 Sobic001G245800 Sobic004G170800--Sobic001G245800 Sobic003G250700 Sobic003G250700 Sobic004G170800--Sobic003G250700 Sobic005G142500 Sobic005G142500 Sobic004G170800--Sobic005G142500 Sobic003G115200 Sobic003G115200 Sobic004G170800--Sobic003G115200 Sobic009G221800 Sobic009G221800 Sobic004G170800--Sobic009G221800 Sobic001G264300 Sobic001G264300 Sobic004G170800--Sobic001G264300 Sobic004G170800--Sobic005G047100 Sobic004G170800--Sobic003G321400 Sobic001G107200--Sobic001G528600 Sobic006G191700 Sobic006G191700 Sobic001G107200--Sobic006G191700 Sobic001G107100 Sobic001G107100 Sobic001G107200--Sobic001G107100 Sobic002G350400 Sobic002G350400 Sobic001G107200--Sobic002G350400 Sobic001G107200--Sobic005G047100 Sobic007G094400 Sobic007G094400 Sobic001G107200--Sobic007G094400 Sobic001G107200--Sobic003G250700 Sobic003G011100 Sobic003G011100 Sobic001G107200--Sobic003G011100 Sobic006G278100 Sobic006G278100 Sobic001G107200--Sobic006G278100 Sobic009G242501--Sobic003G420100 Sobic009G242501--Sobic009G021700 Sobic009G242501--Sobic010G216600 Sobic009G242501--Sobic004G170900 Sobic008G039800 Sobic008G039800 Sobic009G242501--Sobic008G039800 Sobic009G242501--Sobic007G208100 Sobic003G277200 Sobic003G277200 Sobic009G242501--Sobic003G277200 Sobic004G233700 Sobic004G233700 Sobic009G242501--Sobic004G233700 Sobic003G013000 Sobic003G013000 Sobic009G242501--Sobic003G013000 Sobic001G078600 Sobic001G078600 Sobic001G528600--Sobic001G078600 Sobic001G528600--Sobic001G107200 Sobic002G280700 Sobic002G280700 Sobic001G528600--Sobic002G280700 Sobic004G152200 Sobic004G152200 Sobic001G528600--Sobic004G152200 Sobic001G528600--Sobic006G191700 Sobic010G274000 Sobic010G274000 Sobic001G528600--Sobic010G274000 Sobic004G331200 Sobic004G331200 Sobic001G528600--Sobic004G331200 Sobic001G528600--Sobic005G047100 Sobic006G102900 Sobic006G102900 Sobic001G528600--Sobic006G102900 Sobic008G143000--Sobic004G156900 Sobic008G143000--Sobic009G021700 Sobic003G003700 Sobic003G003700 Sobic008G143000--Sobic003G003700 Sobic004G054000 Sobic004G054000 Sobic008G143000--Sobic004G054000 Sobic008G143000--Sobic003G420100 Sobic001G522700 Sobic001G522700 Sobic008G143000--Sobic001G522700 Sobic002G357800 Sobic002G357800 Sobic008G143000--Sobic002G357800 Sobic008G143000--Sobic002G280300 Sobic003G151900 Sobic003G151900 Sobic008G143000--Sobic003G151900
Octagon: transcription factors


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