Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G075200.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QHS7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G392700 AP2 domain containing protein, expressed K09285: OVM, AP2-like factor, ANT lineage
2 Sobic.002G147400 homeodomain-related, putative, expressed -
3 Sobic.001G075201 - -
4 Sobic.006G062600 TUDOR protein with multiple SNc domains, putative, expressed K15979: staphylococcal nuclease domain-containing protein 1
5 Sobic.009G056900 acetyltransferase, GNAT family protein, expressed -
6 Sobic.009G119100 hexokinase, putative, expressed K00844: hexokinase
7 Sobic.008G154600 pectinesterase inhibitor domain containing protein, putative, expressed -
8 Sobic.005G201200 - -
9 Sobic.007G068200 starch synthase III, putative, expressed -
10 Sobic.002G066700 OsFBL33 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
11 Sobic.001G053350 - -
12 Sobic.002G014032 - -
13 Sobic.007G080200 MBTB21 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
14 Sobic.001G194500 - -
15 Sobic.002G016000 OsFBL32 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
16 Sobic.008G041300 - K14777: DDX47, ATP-dependent RNA helicase DDX47/RRP3
17 Sobic.004G186400 - -
18 Sobic.001G305200 expressed protein -
19 Sobic.006G038700 - -
20 Sobic.010G198400 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic001G075200 Sobic001G075200 Sobic001G392700 Sobic001G392700 Sobic001G075200--Sobic001G392700 Sobic002G147400 Sobic002G147400 Sobic001G075200--Sobic002G147400 Sobic001G075201 Sobic001G075201 Sobic001G075200--Sobic001G075201 Sobic006G062600 Sobic006G062600 Sobic001G075200--Sobic006G062600 Sobic009G056900 Sobic009G056900 Sobic001G075200--Sobic009G056900 Sobic009G119100 Sobic009G119100 Sobic001G075200--Sobic009G119100 Sobic008G154600 Sobic008G154600 Sobic001G075200--Sobic008G154600 Sobic005G201200 Sobic005G201200 Sobic001G075200--Sobic005G201200 Sobic007G068200 Sobic007G068200 Sobic001G075200--Sobic007G068200 Sobic001G392700--Sobic009G056900 Sobic001G392700--Sobic002G147400 Sobic001G392700--Sobic001G075201 Sobic002G066700 Sobic002G066700 Sobic001G392700--Sobic002G066700 Sobic001G392700--Sobic001G075200 Sobic001G392700--Sobic005G201200 Sobic001G392700--Sobic008G154600 Sobic001G392700--Sobic006G062600 Sobic002G266600 Sobic002G266600 Sobic001G392700--Sobic002G266600 Sobic002G147400--Sobic009G056900 Sobic002G147400--Sobic002G066700 Sobic002G147400--Sobic001G392700 Sobic002G147400--Sobic001G075201 Sobic002G147400--Sobic005G201200 Sobic002G147400--Sobic001G075200 Sobic006G038700 Sobic006G038700 Sobic002G147400--Sobic006G038700 Sobic001G194500 Sobic001G194500 Sobic002G147400--Sobic001G194500 Sobic002G016000 Sobic002G016000 Sobic002G147400--Sobic002G016000 Sobic001G075201--Sobic009G119100 Sobic001G075201--Sobic001G392700 Sobic001G075201--Sobic009G056900 Sobic001G075201--Sobic002G147400 Sobic001G075201--Sobic001G075200 Sobic001G075201--Sobic005G201200 Sobic001G075201--Sobic008G154600 Sobic002G014032 Sobic002G014032 Sobic001G075201--Sobic002G014032 Sobic001G075201--Sobic006G038700 Sobic006G062600--Sobic001G392700 Sobic006G062600--Sobic009G056900 Sobic006G062600--Sobic001G075200 Sobic006G062600--Sobic007G068200 Sobic006G062600--Sobic002G147400 Sobic006G062600--Sobic002G066700 Sobic010G207900 Sobic010G207900 Sobic006G062600--Sobic010G207900 Sobic006G062600--Sobic001G075201 Sobic007G086701 Sobic007G086701 Sobic006G062600--Sobic007G086701 Sobic009G056900--Sobic002G066700 Sobic009G056900--Sobic001G392700 Sobic009G056900--Sobic002G147400 Sobic009G056900--Sobic001G075201 Sobic009G056900--Sobic005G201200 Sobic009G056900--Sobic006G038700 Sobic009G056900--Sobic002G016000 Sobic009G056900--Sobic002G266600 Sobic003G167200 Sobic003G167200 Sobic009G056900--Sobic003G167200 Sobic009G119100--Sobic001G075201 Sobic009G119100--Sobic008G154600 Sobic009G119100--Sobic002G014032 Sobic009G119100--Sobic009G056900 Sobic009G119100--Sobic001G392700 Sobic009G119100--Sobic001G075200 Sobic009G119100--Sobic002G147400 Sobic004G041300 Sobic004G041300 Sobic009G119100--Sobic004G041300 Sobic004G186400 Sobic004G186400 Sobic009G119100--Sobic004G186400 Sobic008G154600--Sobic009G119100 Sobic008G154600--Sobic001G075201 Sobic008G154600--Sobic001G392700 Sobic001G305200 Sobic001G305200 Sobic008G154600--Sobic001G305200 Sobic008G154600--Sobic002G147400 Sobic008G154600--Sobic009G056900 Sobic008G154600--Sobic001G075200 Sobic008G154600--Sobic004G186400 Sobic001G313150 Sobic001G313150 Sobic008G154600--Sobic001G313150 Sobic005G201200--Sobic002G016000 Sobic008G007800 Sobic008G007800 Sobic005G201200--Sobic008G007800 Sobic005G201200--Sobic006G038700 Sobic004G064800 Sobic004G064800 Sobic005G201200--Sobic004G064800 Sobic009G006700 Sobic009G006700 Sobic005G201200--Sobic009G006700 Sobic010G255400 Sobic010G255400 Sobic005G201200--Sobic010G255400 Sobic005G201200--Sobic002G066700 Sobic002G304500 Sobic002G304500 Sobic005G201200--Sobic002G304500 Sobic005G201200--Sobic002G147400 Sobic007G068200--Sobic006G062600 Sobic002G016800 Sobic002G016800 Sobic007G068200--Sobic002G016800 Sobic007G068200--Sobic001G075200 Sobic007G080200 Sobic007G080200 Sobic007G068200--Sobic007G080200 Sobic009G056100 Sobic009G056100 Sobic007G068200--Sobic009G056100 Sobic007G068200--Sobic001G392700 Sobic004G163700 Sobic004G163700 Sobic007G068200--Sobic004G163700 Sobic006G018751 Sobic006G018751 Sobic007G068200--Sobic006G018751 Sobic005G172800 Sobic005G172800 Sobic007G068200--Sobic005G172800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.