Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G057650.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VVU5
Pfam PF03168
Panther DB PTHR31415 PTHR31415:SF19
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G35980 : Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g14660.1 : harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G212400 zinc finger, C3HC4 type family protein, expressed -
2 Sobic.009G039700 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
3 Sobic.001G301100 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
4 Sobic.005G174600 - -
5 Sobic.005G148700 - -
6 Sobic.005G221200 - -
7 Sobic.009G039500 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
8 Sobic.005G109900 cytochrome P450, putative, expressed K05917: sterol 14alpha-demethylase
9 Sobic.005G109800 cytochrome P450, putative, expressed K05917: sterol 14alpha-demethylase
10 Sobic.005G149800 - -
11 Sobic.005G153500 - -
12 Sobic.005G141500 - -
13 Sobic.002G061200 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -
14 Sobic.005G174700 DEFL74 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
15 Sobic.007G109400 response regulator receiver domain containing protein, expressed K14492: two-component response regulator ARR-A family
16 Sobic.004G017700 trehalose-6-phosphate synthase, putative, expressed K16055: trehalose 6-phosphate synthase/phosphatase
17 Sobic.009G006800 eukaryotic initiation factor iso-4F subunit p82-34, putative, expressed -
18 Sobic.003G438300 - -
19 Sobic.003G415800 DEF9 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
20 Sobic.003G135201 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G057650 Sobic003G057650 Sobic002G212400 Sobic002G212400 Sobic003G057650--Sobic002G212400 Sobic009G039700 Sobic009G039700 Sobic003G057650--Sobic009G039700 Sobic001G301100 Sobic001G301100 Sobic003G057650--Sobic001G301100 Sobic005G174600 Sobic005G174600 Sobic003G057650--Sobic005G174600 Sobic005G148700 Sobic005G148700 Sobic003G057650--Sobic005G148700 Sobic005G221200 Sobic005G221200 Sobic003G057650--Sobic005G221200 Sobic009G039500 Sobic009G039500 Sobic003G057650--Sobic009G039500 Sobic005G109900 Sobic005G109900 Sobic003G057650--Sobic005G109900 Sobic005G109800 Sobic005G109800 Sobic003G057650--Sobic005G109800 Sobic002G212400--Sobic005G109800 Sobic002G212400--Sobic009G039500 Sobic003G415800 Sobic003G415800 Sobic002G212400--Sobic003G415800 Sobic002G061200 Sobic002G061200 Sobic002G212400--Sobic002G061200 Sobic002G212400--Sobic005G109900 Sobic007G109400 Sobic007G109400 Sobic002G212400--Sobic007G109400 Sobic002G212400--Sobic005G174600 Sobic009G006800 Sobic009G006800 Sobic002G212400--Sobic009G006800 Sobic005G149800 Sobic005G149800 Sobic002G212400--Sobic005G149800 Sobic009G039700--Sobic005G109900 Sobic009G039700--Sobic005G221200 Sobic009G039700--Sobic005G148700 Sobic005G141500 Sobic005G141500 Sobic009G039700--Sobic005G141500 Sobic005G174700 Sobic005G174700 Sobic009G039700--Sobic005G174700 Sobic009G039700--Sobic005G174600 Sobic009G039700--Sobic009G039500 Sobic009G039700--Sobic005G109800 Sobic006G276401 Sobic006G276401 Sobic009G039700--Sobic006G276401 Sobic001G301100--Sobic009G006800 Sobic001G301100--Sobic003G415800 Sobic001G301100--Sobic009G039700 Sobic001G301100--Sobic005G109800 Sobic001G301100--Sobic005G174600 Sobic001G301100--Sobic005G109900 Sobic010G137700 Sobic010G137700 Sobic001G301100--Sobic010G137700 Sobic001G301100--Sobic005G141500 Sobic001G270600 Sobic001G270600 Sobic001G301100--Sobic001G270600 Sobic005G174600--Sobic005G141500 Sobic005G174600--Sobic005G221200 Sobic005G174600--Sobic005G109900 Sobic005G174600--Sobic009G006800 Sobic005G174600--Sobic005G109800 Sobic003G135201 Sobic003G135201 Sobic005G174600--Sobic003G135201 Sobic005G174600--Sobic009G039700 Sobic005G174600--Sobic009G039500 Sobic005G174600--Sobic003G415800 Sobic005G148700--Sobic006G276401 Sobic005G148700--Sobic005G221200 Sobic005G148700--Sobic009G039700 Sobic005G148700--Sobic005G141500 Sobic001G323500 Sobic001G323500 Sobic005G148700--Sobic001G323500 Sobic005G148700--Sobic005G174600 Sobic005G148700--Sobic005G109900 Sobic005G147700 Sobic005G147700 Sobic005G148700--Sobic005G147700 Sobic004G017700 Sobic004G017700 Sobic005G148700--Sobic004G017700 Sobic005G221200--Sobic005G141500 Sobic005G221200--Sobic005G174600 Sobic005G221200--Sobic005G109900 Sobic005G221200--Sobic009G039700 Sobic005G221200--Sobic005G148700 Sobic005G221200--Sobic003G135201 Sobic005G221200--Sobic009G006800 Sobic005G221200--Sobic006G276401 Sobic005G221200--Sobic005G109800 Sobic009G039500--Sobic002G061200 Sobic009G039500--Sobic005G109800 Sobic009G039500--Sobic007G109400 Sobic009G039500--Sobic005G109900 Sobic009G039500--Sobic005G174700 Sobic009G039500--Sobic005G174600 Sobic003G438300 Sobic003G438300 Sobic009G039500--Sobic003G438300 Sobic009G039500--Sobic009G039700 Sobic009G039500--Sobic005G221200 Sobic005G109900--Sobic005G174600 Sobic005G109900--Sobic005G109800 Sobic005G109900--Sobic005G141500 Sobic005G109900--Sobic005G221200 Sobic005G109900--Sobic009G039500 Sobic005G109900--Sobic009G039700 Sobic005G109900--Sobic009G006800 Sobic005G109900--Sobic005G174700 Sobic005G109900--Sobic003G135201 Sobic005G109800--Sobic009G039500 Sobic005G109800--Sobic005G109900 Sobic005G109800--Sobic002G061200 Sobic005G109800--Sobic007G109400 Sobic005G109800--Sobic005G174600 Sobic005G109800--Sobic009G006800 Sobic005G109800--Sobic003G415800 Sobic005G109800--Sobic005G141500 Sobic005G109800--Sobic005G221200
Octagon: transcription factors


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